conda——linux环境下的应用商店
miniconda——90%以上的软件都能搜到
学习Linux一定要抛弃图形界面的思维!Linux命令行中没有图形,没有窗口,没有双击,有的只是代码
——豆花老师
安装conda
- 登录服务器
才发现自己day2的作业压根就没登录...操作得还挺开心... - 教程指示下载miniconda tab键自动补齐(具体过程省略)
- 查看当前服务器上安装的所有软件列表
conda list
- 搜索conda软件
conda search 软件名
- 安装软件
conda install 软件名 -y
- 卸载软件
conda remove 软件名 -y
第6步没操作
conda环境
- 查看当前conda有哪些环境
conda info --envs
- 建立conda环境(默认为base)
- 建立一个名叫rnaseq的conda环境,然后指定python版本是3,安装软件fastqc、trimmomatic
conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y
- 激活conda环境:
conda activate rna-seq
(默认的符号*会转移到新建的rna-seq前面来) - 退出当前环境:
conda deactivate