day3- linux环境下的软件安装-daliah

conda——linux环境下的应用商店

miniconda——90%以上的软件都能搜到

学习Linux一定要抛弃图形界面的思维!Linux命令行中没有图形,没有窗口,没有双击,有的只是代码
——豆花老师

安装conda

  1. 登录服务器
    才发现自己day2的作业压根就没登录...操作得还挺开心...
  2. 教程指示下载miniconda tab键自动补齐(具体过程省略)
  3. 查看当前服务器上安装的所有软件列表 conda list
  4. 搜索conda软件 conda search 软件名
  5. 安装软件 conda install 软件名 -y
  6. 卸载软件 conda remove 软件名 -y
    第6步没操作

conda环境

  1. 查看当前conda有哪些环境conda info --envs
  2. 建立conda环境(默认为base)
  3. 建立一个名叫rnaseq的conda环境,然后指定python版本是3,安装软件fastqc、trimmomatic conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y
  4. 激活conda环境: conda activate rna-seq(默认的符号*会转移到新建的rna-seq前面来)
  5. 退出当前环境:conda deactivate
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