GEO （Gene Expression Omnibus）是一个公共功能基因组学数据存储库，支持符合 MIAME 标准的数据提交。 接受基于阵列和序列的数据。 提供工具来帮助用户查询和下载实验和策划的基因表达谱。基本上文章中原始测序数据和过程文件都会提交在这个数据库中，只上传原始测序文件则传到SRA数据库中。
上传流程
1.选择注册账号，可以根据当前账号（163实测没问题）直接注册，也可以通过谷歌邮箱注册（后面填写信息要用（https://www.google.com/intl/zh-CN_cn/gmail/about/）
网址：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/
2.填写信息，然后save，然后选择右上角的GEO submissions，在选择new submissions
邮箱选择自己注册的gmail邮箱即可，右边没有特定需求可以不填
3.点击Sunbmit high-throughput sequencing，详细阅读此界面，上传时一共需要三个（原始数据，过程文件，填写信息的表格）
4.滑到下面，选择Transfer Files,进去后step1是你的绝对路径，step2有address，用户名和密码
上传时建立一个标有日期的文件夹，将所有文件全放置当前文件夹下，不要有子目录
5.上传方式选择（lftp和FileZilla Client）
在服务区网速快且稳定时直接conda安装lftp
lftp user:密码f@ftp-private.ncbi.nlm.nih.gov
cd到你的文件夹下
mirror -R 文件夹路径 ./
放着不动等自动传完就行了
如果服务器网络不稳定，则推荐使用FileZilla Client
在文件这一栏打开站点管理器，如图所示填写，连接成功后如果传输速度依然很慢，可以在编辑这一栏打开设置，点击传输，如下设置
更改并发传输和速度限制
数据传完了，只剩下填表，表格包含两张就可，一张是你实验的信息，需按照指定格式完整填写，另一张是raw data和processed data的MD5值。
代码如上
6.待所有数据上传完成后，就可以进入最后一步，Notify GEO
然后填入你上传的文件夹名。如果文章在投或者暂不想公开数据，GEO数据可以将你的测序文件设为私密（最多3年），这个可以自行设置Release date。最后点击Submit，即完成上传的所有流程。释放时间无需担心，文章投刊时会释放出来。ps:NCBI工作效率还是挺快的，一两天就有人回复，他们觉得没问题后就会把数据存放至另一个位置，原路径文件可能会删除，数据存放两个星期也后会自动删除。
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