R包

R包.png

1.镜像配置

高级模式
 file.edit('~/.Rprofile')
添加：
options("repos" = c(CRAN="[https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/](https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/)"))
options(BioC_mirror="[https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/](https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/)") 
保存，重启Rstudio
再运行：options()$repos和options()$BioC_mirror 就已经配置好了

镜像.png

2.安装加载三部曲

options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) 
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") 
install.packages("dplyr")  #安装包存在CRAN用这个
BiocManager::install(“dplyr”) #安装包存在Biocductor用这个
library(dplyr)   #或者require(包)

3.dplyr五个基础函数

1.mutate(),新增列

mutate.png

2.select(),按列筛选

(1)按列号筛选
举个例子

select.png

(2)按列名筛选
举个例子

select2.png

3.filter()筛选行

filter.png

4.arrange(),按某1列或某几列对整个表格进行排序

举个例子

arrange.png

PS：desc是降序排列（即从大到小排列）

5.summarise()：汇总

举个例子

summaries.png

4.dplyr两个实用技能

管道操作 %>% (cmd/ctr + shift + M)

加载任意一个tidyverse包即可用管道符号

管道.png

count统计某列的unique值

count.png

5. dplyr处理关系数据

1.內连inner_join,取交集

inner.png

2.左连left_join

left.png

3.全连full_join

full.png

4.半连接：返回能够与y表匹配的x表所有记录semi_join

semi.png

5.反连接：返回无法与y表匹配的x表的所记录anti_join

anti.png

6.简单合并

bind_rows()   #函数需要两个表格列数相同
bind_cols()   #函数则需要两个数据框有相同的行数

举个例子

bind.png

总结

安装包时出现了问题，很蠢的问题，被一起学习的小伙伴提醒，瞬间找到问题所在，感谢小伙伴！学到点点R包的基础，感觉也很有用，加油学习！