参考 https://www.jianshu.com/p/a63595a41bed # 生信技能树推文
1、DNA链的基本概念
正链和负链 : DNA中反向互补的链。参考基因组给出的那个链就是所谓的正
链(forword),另一条链是反链(reverse)。
正义链(sense strand):两条互补的DNA链其中一条携带编码蛋白质信息的链称为正义链,又称编码链,因为它的序列与mRNA相同。
反义链(antisense strand):另一条与之互补的称为反义链。而反义链虽然和RNA反向互补,但它可是真正给RNA当模板的链,因此反义链也是模板链。
正义链(sense strand)= 编码链(coding strand)= 非模板链
反义链(antisense strand)= 模板链 (和编码链反向互补)
forword strand = sense strand + antisense strand
reverse strand = sense strand + antisense strand
2、链特异性测序
建库方式以dUTP为例,首先用随机引物合成RNA的第一条cDNA,合成第二条cDNA时用dUTP替代dTTP,加adaptor后用UDGase处理,将有U的第二条cDNA降解,只留下含有U的第一条cDNA,dDTP=fr-firststrand。 firststrand非RNA strand(即非正义链)
avatar