参考 https://www.jianshu.com/p/a63595a41bed # 生信技能树推文

1、DNA链的基本概念

正链和负链 : DNA中反向互补的链。参考基因组给出的那个链就是所谓的正
链（forword），另一条链是反链（reverse）。

正义链（sense strand）：两条互补的DNA链其中一条携带编码蛋白质信息的链称为正义链，又称编码链，因为它的序列与mRNA相同。

反义链（antisense strand）：另一条与之互补的称为反义链。而反义链虽然和RNA反向互补，但它可是真正给RNA当模板的链，因此反义链也是模板链。

正义链（sense strand）= 编码链（coding strand）= 非模板链
反义链（antisense strand）= 模板链 （和编码链反向互补）
forword strand = sense strand + antisense strand
reverse strand = sense strand + antisense strand

2、链特异性测序

建库方式以dUTP为例，首先用随机引物合成RNA的第一条cDNA,合成第二条cDNA时用dUTP替代dTTP，加adaptor后用UDGase处理，将有U的第二条cDNA降解，只留下含有U的第一条cDNA,dDTP=fr-firststrand。 firststrand非RNA strand(即非正义链)

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