学习小组Day3-杨咩咩

由于打开ubantu后,发现仍是自己之前的,所以再次登录


重新登陆.png

这次不需要重新输入,因为之前已经成功,所以这次一下子就登陆了

将miniconda下载到服务器上

1.输入命令 uname -a查看

查看.jpg

从这里我们可以看出服务器是64-bit(x86_64)
2.登陆服务器,进入biosoft目录
3.输入如图所示,安装
安装.png

安装1.png

4.输入source ~/.bashrc激活,输入conda
conda.jpg

5.添加镜像
镜像.jpg

6.开始使用conda
(1) 查看当前服务器上安装的所有软件列表 conda list
conda list.png

(2)安装软件 conda install fastqc -y
install.jpg

(3)确认fastqc软件是否安装成功
help.jpg

(4)卸载软件 conda remove fastqc -y
rm失败.jpg

再次输入命令即可成功
rm.jpg

7.其他
①查看当前conda有哪些环境,输入conda info --envs,建立一个名叫rnaseq的conda环境,然后指定python版本是3,安装软件fastqc、trimmomatic
查看环境和创建.jpg

②再次查看一下我们的conda环境,conda info --envs ,多了一个rna-seq。但是发现,默认还是base。所以需要激活新的conda环境。
安装新的conda环境.png

即可看到默认编程了ran-seq

思维导图:
Linux环境下的软件安装.png
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