坦白局-值得一看

坦白局

原创: 生信技能树 生信技能树 2月13日
春节旅途折腾,所以玩了个坦白局,很多人问的问题特别正能量,值得记录一下并且分享给所有的粉丝.

Q1: 您是生信行业前沿科学工作翘楚,又致力国内生信知识的普及—-请问怎么看未来5年,10年中国及外国生信方向的机会和行业发展方向

不仅仅是生物学,可以说所有的科学行业都已经信息化或处于信息化的阶段,那么生物信息学必然是一个高速发展的学科,或者说是方向吧。谷歌的CEO施密特不是说一句话么:“如果有人给你在火箭上提供了一个位置,那么,别管位置好坏,先上去再说。”

因为你跟着这个火箭,你的速度会比所有其他交通工具都快,我们这生物信息学也是一样的。你只需要你现在需要做的就是先学,先上车,不管是普通的R语言还是高级的NGS,这些东西你先学好一定是非常有用的,这些技能在你所有科研生涯里面是一个非常大的助力,先上来再说。

未来五年十年,我说的也不算,因为我入行也就五年,依稀记得五年前测一个普通的转录组要两万多,现在1000块都不到,这个变化实在是太快了,很有可能未来十年就全民全基因组都免费,所有人都有自己的基因组数据,这将会是医疗行业健康行业全部发生巨大变革。如果我要是能提前预测这些东西或者我能看到清晰的方向,我就自己去创业啦。但是我现在看不到,我只知道我现在努力肯定是对的,我努力,总有一天我会看到的。

Q2: 我感到您身上有一种使命感,和凝聚力,把大家召集在一起,来一起创造一个愿景和未来。您也特别无私的分享很多知识,也带动一个分享的氛围。 —-请问过去在您身上是什么样的契机和经历,让您做这样一份勇敢又坚持的创业和选择呢

为什么会选择条路并且坚持下去呢?其实很简单,就是一个非常小的尝试,加上持续不断的正反馈。所谓非常小的尝试,就是五年前选择转行进入生物信息领域的时候,是一个纯粹的外行。在那个年代博客是很少了的,而且大家写的那几个教程非常有限,而且基本上不对我的胃口。在自行摸索的学习过程中,受到了挫折特别多,各种软件都只有英文的说明书,没有中文的。而且,随便一个说明书都是200多页的,PDF根本抓不到重点,所以我就想做一个尝试,把软件,精简成三部曲,如何安装,怎么样在测试数据上使用它,最小参数使用,最后怎么解释这个结果。结果很不错,非常受欢迎,陆陆续续都有人写邮件或者留言感谢我,这样的正反馈就促使我一直坚持下来了,坚持了五年。

我并不是主动选择五年后的自己,而是因为处于这个时代所以,就恰好做了这个事情。然后我觉得在接下来的过程中,会涌现很多和我一样的优秀的小伙伴,他们也会来做分享。我非常欢迎大家传承我的信念,在做分享的过程中,会不停的督促自己学习的。不少两三年前跟我学习的小伙伴,他们现在也有自己的博客,所以我们形成了生信技能树联盟。然后我觉得,生物信息学和生物搭边,所以其研究方向和范围非常之广泛,不是单独的莫个人能够做完的知识整理和分享,必然是一个团队。而我恰好又处于这样的一个中心和结点,那么我觉得我恰好有这个资质,或者就像你说的这种使命感,带领大家把这件事情做好,而且我也非常享受这个角色。

Q3: 我想请教你一个问题,我觉得自己很多事情想做,但老是精力不足,效率低下。我想向你请教一下,你是否有跑步的习惯,坚持晨跑吗?因为我的职业决定了一般是早晨开展的才容易坚持,晚上的话时间太不固定了

你能问我这个问题,说明你认为我在检查做生物信息学知识整理分享了,而且做得还不错!的确,我就是坚持写教程了,主要是学习新的R包测评,新的软件的用法。正是因为我这五年来在不停的学新的东西,所以知识面才会这么广阔。再加上2018到现在的话,阅读了大量相关的文献,原则上是每周一篇笔记。一年的话就有48篇,每一篇文献背后又有十几篇背景知识文献,这样的话,相当于每年的阅读文献量超过400篇,所以算是一个蛮大的阅读量的。

比如春节七天我带病完成的文献阅读笔记的分享,目录如下:
2019年1月份第1周(总第49周)单细胞转录组探索CAFs的功能和空间异质性
2019年1月份第2周(总第50周)异常CRC病人的突变时空异质性与免疫
2019年1月份第3周(总第51周)探索PDAC癌前病变
2019年1月份第4周(总第52周)TCGA计划的ATAC-seq数据发布
2019年2月份第1周(总第53周)胃癌类器官
2019年2月份第2周(总第54周)测173个成年人的大脑的102个基因
2019年2月份第3周(总第55周)2.5万汉族人的GWAS乳腺癌风险基因

我这个坚持呢,主要是自找的。比较那么多粉丝看着我,我对自己有这个要求,而且也夸出海口了,我要读这么多文献并且分享,那么我如果不做到相当于身败名裂,可以理解为我把自己绑在这一个不得不做的战车上。有点类似于你想翻墙出校园吃小吃,你先把书包丢过去,然后你就不得不翻过去了,哪怕你能力不够,也会想尽全力的翻过去,因为翻不过去,你的书包就拿不回来了。

至于会觉得很多事情要做,但老是精力不足,效率低下。这个问题我也有,我当然也非常忙,忙到什么程度呢,有好几个实习生要带,还有员工要培养和谈心,每天还得回复一些粉丝来信,还有全国巡讲等事情要安排,当然会觉得自己精力经常顾不上。但是呢,目前为止,所有的事情都稳步推进,可能是因为我把事情分为轻重缓急了。即使有很多事情,它可能非常重要,但他就是被我忽略了,那也没有办法,因为这就是人生,没有十全十美。我既然做到了很多值得大家鼓励的成果,就不会去再看那些被忽略掉的小细节,因为有一点点成功就足以推动我们继续往前走了。

我并没有觉得精力不足,至于你说的效率低下,我通常认为是,你还没有熟练掌握。就是说,你很多背景知识没有,就被迫从事了那一些,对你来说有点挑战的。有挑战的,其实你应该花很多时间在背景知识的学习上面,这样的话,你在做新的东西的时候,你的效率会高一点,因为你有足够的背景知识支撑你去,在上面进行推理,还有逻辑思考,还有各种事情,都是在你的已有的知识水平上面思考。所以呢,关于效率问题,你不妨思考一下是不是有什么基础知识没有学,就接受了高级的任务、有难度的东西。

在去年,乃至3年前我还有坚持晨跑的习惯,如果翻看我的朋友圈还可以看到打卡的信息。但是呢,我自从开办公司之后,事情比较多,所以这个日常跑步打卡早就停了半年多了。如果我接下来的半年把公司做好之后,可能我会再重启这个晨跑的习惯吧。我其实并没有什么很严格的计划,我的规划都是按照星期、按照月度来的,就是把一些事情,比如公众号的推文的撰写,还有新的技术的学习,新的R包、网站工具的使用,还有这些新的视频的录制等重要的的事情优先级提高即可。我只需要把主线抓住,就觉得挺好的,比如说我还有单细胞课程呢,还有一些TCGA的课程继续录制。我通常就是把主线抓住,争取每天完成一点点主线任务,其余的支线任务的话,就是看能力,看缘分,可以做就做,不做的话也无关紧要,因为主线任务排在我的首位。

Q4: 我们植物研究方向的硕博生毕业后出路很有限,如果想往临床医学方向转,该做怎么样的努力?

因为是老熟人,所以我邮件给了他约50个癌症研究的名词,希望他可以整理,形成自己的知识背景。

然后给了他十几篇癌症研究具体的一个方向的历年综述,希望他可以翻译其中一篇。

然后给了他两个代码,希望可以把这样的代码套用到TCGA的所有癌症数据集里面,同样是扩充自己的知识背景。

几个忠告

身体是革命的本钱,努力拼搏的前提是有个健康的身体。

勇敢一点,尝试一下。

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