时序聚类

方法使用参见官方文档:
https://tslearn.readthedocs.io/en/latest/gen_modules/tslearn.clustering.html#module-tslearn.clustering

from tslearn.clustering import GlobalAlignmentKernelKMeans, TimeSeriesKMeans, KShape
from tslearn.metrics import sigma_gak
from tslearn.preprocessing import to_time_series_dataset
from tslearn.generators import random_walks

def cluster_method(x, method, max_iter, n_cluster=3, seed=100):
    if method == 'KShape':
        x = TimeSeriesScalerMeanVariance(mu=0., std=1.).fit_transform(x)  #数据标准化
        model = KShape(n_clusters=n_cluster, max_iter=max_iter, n_init=1, random_state=seed).fit(x)
    elif method == 'KMeans_euclidean':
        model = TimeSeriesKMeans(n_clusters=n_cluster, metric="euclidean", max_iter=max_iter,
                      random_state=seed).fit(x)
    elif method == 'KMeans_dtw':
        model = TimeSeriesKMeans(n_clusters=n_cluster, metric="dtw", max_iter=max_iter, 
                                 max_iter_barycenter=100,random_state=seed).fit(x)
    elif method == 'KMeans_softdtw':
        model = TimeSeriesKMeans(n_clusters=n_cluster, metric="softdtw", max_iter=max_iter, 
                                 max_iter_barycenter=100,metric_params={"gamma": .5}, random_state=seed).fit(x)
    elif method == 'KernelKMeans':
        model = GlobalAlignmentKernelKMeans(n_clusters=n_cluster,
                                     sigma=sigma_gak(input_data),
                                     n_init=20,
                                     verbose=False,
                                     random_state=seed).fit(x)        
    return model

def input_data_process(method):
    if method in ('KMeans_euclidean','KShape'):  # 要求时序等长
        x = random_walks(n_ts=50, sz=32, d=1)
    else:  # 其他方法序列可不等长
        x = to_time_series_dataset([[1, 2, 3, 4],[1, 2, 3],[2, 5, 6, 7, 8, 9]])  # to_time_series_dataset可将list转换成时序聚类模型需要的输入格式
    return x

if __name__ == '__main__':
    method = 'KMeans_euclidean'
    input_data = input_data_process(method=method)
    model = cluster_method(x=input_data, method=method, n_cluster=2, max_iter=100, seed=100)
    pred = model.predict(input_data)
    pred

最后编辑于
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 215,384评论 6 497
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 91,845评论 3 391
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 161,148评论 0 351
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 57,640评论 1 290
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 66,731评论 6 388
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 50,712评论 1 294
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 39,703评论 3 415
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 38,473评论 0 270
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 44,915评论 1 307
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 37,227评论 2 331
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 39,384评论 1 345
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 35,063评论 5 340
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 40,706评论 3 324
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 31,302评论 0 21
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 32,531评论 1 268
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 47,321评论 2 368
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 44,248评论 2 352

推荐阅读更多精彩内容