该剧讲述了兽医郝运因为一场猫咪配种事故，意外发现这个世上有转化者的存在，从而被迫加入动物管理局成为一名探员，开启了一个巨大而神秘的都市精灵世界的故事，同时郝运发现他的身边到处都是转化者。
除此之外，孤独、愤怒、嫉妒、固执、缺心眼，一桩桩动物案件，让郝运意识到转化者世界也不外乎柴米油盐、悲欢离合，精于人情世故的郝运和战斗力超强的吴爱爱组成搭档，最终牵扯出一桩关于郝运身世的转化者大案。
郝运，性格怂萌却又精于人情世故。本是人类世界的一名兽医，在一场猫咪配种事故中意外发现动物可以变成人，同时发现无法被清洗记忆，从而被迫加入动物管理局，以人类的身份和众多妖怪一起工作，同搭档吴爱爱侦破一桩桩啼笑皆非的案件。
吴爱爱，动物管理局金牌探员，真实身份是黄鳝，雌雄同体。平时是女人的样子，当心跳超过一百八的时候会变成男人，当年龄达到22岁的时候，就会永久性的变成男人。作为动物管理局治安组组长，性格火爆、武力极高，同人类身份的兽医郝运一起侦破案件、维护人与妖和平。
最开始看到这部剧的时候就觉得它的题材很新颖、脑洞大开，虽是喜剧但表达高级。依托于都市寓言故事的叙事框架，通过有味道的狐狸放屁案、洄游症杀手鱼圆梦案、蚯蚓烧脑分身案等富有创意同时映射现实的剧情，完成了对社会众生相的解构，于嬉笑怒骂中启迪观众勇于面对人生的磨难。
因为是和动物有关，在这部剧中出现了很多动物，如猫、狗、大鹅、泰迪、金鱼、熊猫等，难得的是这些动物都不是特效，是对真实动物进行拍摄的。不过除了受过专业训练的动物可以在拍戏时基本不NG，其他大部分动物都很难操控。
比如熊猫只能去动物园拍，还有像大鹅这种没有专业人士训练的动物，工作人员必须全程跟拍动物，随时捕捉一些特写细节，再通过后期剪辑将意思完全不一样的反应，剪辑成剧本想让其表达的意思，这是很难能可贵的。
除此之外，女主作为雌雄同体的设定也是稀奇的。每次看到郝运和吴爱爱甜甜的约会谈恋爱的时候，既担心又好奇吴爱爱变身后的情景，真的是半夜都能笑出声。
《动物管理局》通过这些一个个温暖、治愈的故事，不止实现了题材的突破，也延伸了情怀的触角，更加传播了社会正能量。
