第5天学习R语言数据结构，也是后续使用中基础的基础，还是要熟练掌握，这都是学习过程中必踩的坑......
R语言数据结构
向量和数据框
1.向量
a.标量和向量
- 元素：数字或者字符串（用chr表示）等
- 标量：一个元素组成的变量
- 向量：多个元素组成的变量（函数c()可用来创建向量）
用于储存数值型、字符型或逻辑型数据的以为数组。
创立了变量，自然就需要给变量赋值（给变量赋予数值、字符串或数据框等）:使用“<-”赋值，“=”也可但并不规范；
ps:多次赋值时会不断覆盖，以最后一次为准。
示例数据来自生信星球 花花老师（下文代码均来自于生信星球花花老师）
x<- c(1,2,3) #常用的向量写法，意为将x定义为由元素1，2，3组成的向量。
x<- 1:10 #从1-10之间所有的整数
x<- seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数（注意是逗号不是分号）
x<- rep(1:3,times=2) #1-3 重复2次
b.从向量中提取元素
x[4] #x第4个元素
x[-4]#排除法，除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4]#第2到4个元素
x[-(2:4)]#除了第2-4个元素
x[c(1,5)] #第1个和第5个元素
2.数据框
a.读取本地数据
read.table(file="huahua.txt",sep="\t",header=T)
a<-read(file="huahua.txt",sep="\t",header=T)
查看数据
需要将读取的数据放置在工作目录下，查了一下：
file.choose()参数可以自行选择文件，包括工作目录外的文件。
b.设置行名和列名
X<-read.csv('doudou.txt') #在示例数据里有doudou.txt 注意这里的变量X是一个数据框
colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名,默认值的行名就是行号，1.2.3.4...
colnames(X)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回数据，左上角第一格为空，R会自动补为x,用这个命令来修改
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名
c.数据框的导出
write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号，字符串不加双引号（默认格式带由双引号）
d.变量的保存与重新加载
save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
save(X,file="test.RData")#保存其中一个变量
load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令
e.提取元素
X[x,y]#第x行第y列
X[x,]#第x行
X[,y]#第y列
X[y] #也是第y列
X[a:b]#第a列到第b列
X[c(a,b)]#第a列和第b列
X$列名
f.直接使用数据框数据
a <-data.frame(case=paste("S",1:50),values=runif(50))
plot(a$case,a$values)
散点图
但花花老师觉得这样太繁杂，给出了attach以及with函数：
attach
将数据框名添加到搜索环境中,
attach()
plot(case,values)
但需要注意如果环境中的数据框有重复的列名就还需指定数据框。
detach()移除环境
with
with(data, expr, …)函数用于在一个由data数据框构建的环境
其中可以使用<<定义全局环境，with以为也可用。
with
最后惯例思维导图完成学习计划
思维导图
