R包入门
R包学习.png
1.设置镜像
使用R的配置文件.Rprofile
file.edit('~/.Rprofile')
在文件里添加
options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) #对应清华源
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") #对应中科大源
2.学习dplyr包
2.1 5个函数
mutate()#新增列
select()#按列筛选
filter()#筛选行
arrange()#按某1列或某几列对整个表格进行排序
arrange(test, desc(Sepal.Length))#用desc从大到小，默认为从小到大
summarise()#汇总
3.1管道操作
%>% (cmd/ctr + shift + M)
3.2 count统计某列的unique值
> test %>%
+ group_by(Species) %>%
+ summarise(mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))
# A tibble: 3 x 3
Species `mean(Sepal.Length)` `sd(Sepal.Length)`
<fct> <dbl> <dbl>
1 setosa 5 0.141
2 versicolor 6.7 0.424
3 virginica 6.05 0.354
> count(test,Species)
# A tibble: 3 x 2
Species n
<fct> <int>
1 setosa 2
2 versicolor 2
3 virginica 2
4.处理数据关系
stringsAsFactors = FALSE: 字符型数据读入时自动转换为因子，防止转换为因子， 令参数stringsAsFactors = FALSE， 防止导入的数据任何因子的转换。
options(stringsAsFactors = F)
inner_join()#取交集
left_join(）#左联
full_join(）#
semi_join(x = test1, y = test2, by = 'x')#半连接：返回能够与y表匹配的x表所有记录semi_join
anti_join(x = test2, y = test1, by = 'x')
#5.反连接：返回无法与y表匹配的x表的所记录anti_join
bind_rows()#需要两个表格列数相同
bind_cols()#需要两个数据框有相同的行数
#在相当于base包里的rbind()函数和cbind()函数
