具体如何在Android中使用ffmpeg可参考在android studio中使用FFmpeg。
下面只是列一下相关的命令。（毕竟我比较懒）
如果要把音频比如一个mp3合成到视频中。最简单的例子如下：

Runnable compoundRun=new Runnable() {
            @Override
            public void run() {
                String[] commands = new String[6];
                commands[0] = "ffmpeg";
                commands[1] = "-i";
                commands[2] = videoUrl;
                commands[3] = "-i";
                commands[4] = musicUrl;
                commands[5] = outputUrl;

                FFmpegKit.execute(commands, new FFmpegKit.KitInterface() {
                    @Override
                    public void onStart() {
                        Log.d("FFmpegLog LOGCAT","FFmpeg 命令行开始执行了...");
                    }

                    @Override
                    public void onProgress(int progress) {
                        Log.d("FFmpegLog LOGCAT","done com"+"FFmpeg 命令行执行进度..."+progress);
                    }

                    @Override
                    public void onEnd(int result) {
                        Log.d("FFmpegLog LOGCAT","FFmpeg 命令行执行完成...");
//                        getWindow().setFlags(0, WindowManager.LayoutParams.FLAG_KEEP_SCREEN_ON);
//                        Message msg = new Message();
//                        msg.what = 1;
//                        mHandler.sendMessage(msg);
                    }
                });
            }
        };
        ThreadPoolUtils.execute(compoundRun);

so easy!
这样，两个文件就会合并。
然而，如果视频比音频短，那视频结束后会停在最后一帧，继续播放音频。
这个结果一般来说是说不过去的，所以这里最好加上时间参数。-ss为起始时间，-t为持续时间。这样就可以控制时间，比如按照视频长度合成。
参数类似这样：

String[] commands = new String[10];
commands[0] = "ffmpeg";
commands[1] = "-i";
commands[2] = videoUrl;
commands[3] = "-i";
commands[4] = musicUrl;
commands[5] = "-ss";
commands[6] = "00:00:00";
commands[7] = "-t";
commands[8] = 10;
commands[9] = outputUrl;

上面这个例子里，时间参数是作为输出参数，所以控制的是整体的时长。
如果要控制音频的时长，比如在视频的开始5秒加入音频，5秒后没有音频，那就需要把他们作为输入参数使用。
像这样：

String[] commands = new String[10];
commands[0] = "ffmpeg";
commands[1] = "-i";
commands[2] = videoUrl;
commands[3] = "-ss";
commands[4] = "00:00:00";
commands[5] = "-t";
commands[6] = 5;
commands[7] = "-i";
commands[8] = musicUrl;
commands[9] = outputUrl;

有时候我们还需要调节音频音量。
那么加上-vol 参数，这个参数的值使用百分数，比如1000就是放大十倍。

String[] commands = new String[8];
commands[0] = "ffmpeg";
commands[1] = "-i";
commands[2] = videoUrl;
commands[3] = "-i";
commands[4] = musicUrl;
commands[5] = "-vol";
commands[6] = 1000;
commands[7] = outputUrl;

补充说明：
如果不设置code参数，默认会重新渲染。
如果将code参数设为copy就不会重新渲染，速度会快。

        _commands.add("-acodec");
        _commands.add("copy");
        _commands.add("-vcodec");
        _commands.add("copy");