文献学习090--Recruited macrophages elicit atrial fibrillation

这个月13号online的一篇science

在正常心房组织中,30%是心肌细胞,70%是成纤维、内皮和组织原位免疫细胞。这些细胞辅助维持了心肌细胞的基本功能,包括matrix scaffold、血供、waste removal和免疫监视。房颤AFib是最常见的心律失常,有报道显示免疫可能通过electrical remodeling参与AFib,altered ion handling影响了动作电位。纤维化--炎症的另一个结果,诱导异质性心房去极化,这可能引起electrical conduction reentry和subsequent AFib。为了探究炎症细胞和基质细胞对AFib的贡献,作者使用了单细胞测序对正常和病变的心房组织进行了检测。

1. Macrophages expand in human atrial disease

Fig 1A: 作者采集了5例control和7例持续性房颤患者的左房组织,进行了单细胞测序。
Fig 1B-C: 一共得到41609个细胞,注释为6种细胞大群。在AFib心脏中,MP&DC比例扩增了近两倍,内皮和壁细胞比例降低,其他细胞比例保持稳定。
Fig 1D: 对GSEA分析结果显示,AFib心脏MP&DC的炎症炎症反应相关通路上调,包括IFN-g信号通路、单核细胞招募、胆固醇代谢等。Thus, atrial MP/ DCs undergo substantial immunometabolic remodeling during their expansion in patients with AFib.
Fig 1E: 随后作者进行了weighted correlation network analysis来探究MP/ DCs的转录模式。一共鉴定出12个模块,其中3个与disease state显著相关。模块1在AFib中上调,其中包括炎症和纤维化基因如CCR2, IL10, ITGA9, MMP9, SPP1, TIMP2 和 VIM。而在AFib中下调的模块2和3,下调了一些保护性基因如SIRT2、组织原位巨噬细胞增殖基因KLF4、表观限制细胞因子产生基因HDAC2 和 ODC1。
Fig 1F: Overrepresentation analysis证实炎症和细胞外基质相关基因是模块1的特征。
Fig 1G: 模块1基因SPP1和CCR2以及细胞表面marker TREM2和CD9是AFib患者MP/DCs(和对照相比)最显著上调的基因。
Fig 1H: 随后作者对MP/DCs进行了亚群细分,得到11个亚群,包括4个单核群、5个巨噬群和2个DC群。
Fig 1I: 11个群中,inflammatory mono(b) 群和 SPP1+ mac(c) 群分别扩增了2.8- 和 3.4-倍。
Fig 1J: 和对照相比,AFib患者的SPP1+ atrial cells 百分比显著增加。
Fig 1K-L: SPP1巨噬的marker在SPP1这一群特异性表达。

Fig. 1. Single-cell atlas of human atrial disease
2. A mouse model of atrial disease

Fig 2A: 为了探究人AFib的免疫机制,作者使用了一个小鼠模型,这个模型存在combined hypertension, obesity, and mitral valve regurgitation (HOMER)
Fig 2B: Snaring the mitral valve to the ventricular wall produced mitral valve regurgitation. 小鼠被给予了4个月的obesogenic diet,mirroring the risk that obesity engenders for AFib. Hypertension, also a risk factor for AFib, was induced with angiotensin 2.
Fig 2C: The HOMER model elicited left atrial enlargement commonly found in patients with AFib.
Fig 2D: HOMER mice developed increased AFib inducibility and burden compared with control mice.

Fig 2E-F: 作者对4只HOMER和4只control鼠的心房组织进行了单细胞测序,得到了40112个细胞,鉴定为和人的组织一样的6种细胞群,其中MP/DC显著扩增。
Fig 2G: 病变的小鼠和人的心脏组织细胞比例变化具有很好的一致性[Pearson’s correlation coefficient (r) = 0.87]。
Fig 2H: 流式结果证实了HOMER小鼠心房组织中的巨噬数量增加。
Fig 2I: 向日葵图展示了AFib人和小鼠MP/DC富集到的通路,发现具有很强的相关性,提示HOMER model recapitulated the pathway-level gene expression changes observed in patients。

这个图画的很巧,也就只需要两列数据,人的富集通路的FDR和小鼠富集通路的FDR,行名是通路,直接画就可以了。越靠近右上角的通路 在人和小鼠里都富集越显著,反之。

Fig 2J: 同样的,Spp1在HOMER小鼠的MP/DC中也显著上调。
Fig 2K: 对MP/DC的二次聚类得到18个群。
Fig 2L-P:Spp1巨噬和这个分子本身在AFib中都显著升高(这群细胞的其他marker如Trem2, Cd9都升高)。

3. CCR2-dependent macrophage recruitment promotes AFib

Fig 3A: 为了探究SPP1巨噬的来源,作者使用了Cx3cr1CreER/+Ai9fl/+ mice。结果显示HOMER鼠心房组织中招募来的Td-巨噬比例显著扩增。

Ai9fl-Td/+鼠也就是个Tomato鼠,想了半天也没想明白为什么作者要圈YFP的门,而且作者写的是:recruited (YFP+ Td), locally sourced (YFP+ Td+) left atrial macrophages. 感觉不对啊,跟YFP有什么关系啊,不应该圈YFP,直接根据Td阴性和阳性圈门才对啊🤔

Fig. S21. Sources of left atrial macrophage expansion in HOMER mice.

Anyway,无视YFP接着往下看吧。。。

Fig 3B: HOMER鼠心房中招募来的巨噬高表达Spp1,提示Spp1巨噬是外周招募的细胞来源。
Fig 3C: 随后作者在Ccr2−/−鼠上进行HOMER造模,发现blood monocyte, atrial Ly6Chi monocyte, and macrophage减少,其他细胞则未受影响。
Fig 3D: Ccr2−/−HOMER鼠上进行的TREM2+ CD9+ macrophages也减少。
Fig 3E: Ccr2−/− HOMER 鼠的AFib inducibility 和 AFib burden 也比 C57BL/6 HOMER 鼠要低。
Thus, macrophage recruitment expands during atrial remodeling, recruited macrophages highly express Spp1, and inhibiting macrophage recruitment reduces AFib.

4. Macrophage-derived SPP1 is a pleiotropic AFib catalyst

由于Spp1是AFib中巨噬细胞最显著上调的基因,we examined the causal role of this matricellular protein.
Fig 4A: 作者将Spp1−/−小鼠的骨髓移植给了wild-type recipients (Spp1−/− BMT HOMER)以清除招募的巨噬中的Spp1。接受了WT骨髓移植的wild-type recipients被用于对照。随后作者使用两组小鼠构建了HOMER模型。结果显示Deleting Spp1 in bone marrow– derived cells reduced AFib inducibility and AFib burden.
Fig 4B: 为了探究Spp1-expressing macrophages和其他心房细胞的互作,作者进行了CellPhoneDB分析。结果显示SPP1+ macrophage interactions with client cells via three integrins (a4b1, avb3, and a9b1), CD44, and prostaglandin E2 receptor 4 (EP4/PTGER4).
These interactions, which included signaling to various macrophage and fibroblast clusters, suggested that SPP1 acts as a pleiotropic amplifier for atrial inflammation and fibrosis, which in turn contribute to an AFib substrate.
Fig 4C-D: 与此一致的,作者发现与C57BL/6 BMT HOMER相比,Spp1−/− BMT HOMER小鼠的心房组织中CD68+减少,indicating that SPP1 may influence atrial macrophage supply. 此外,Spp1−/− BMT HOMER小鼠心房组织中巨噬细胞TUNEL没变化,但是增殖下降(附件),提示SPP1 augments atrial inflammation through increased macrophage proliferation. 此外,Spp1−/− BMT HOMER小鼠的心房组织中collagen I 沉积和马松染色出现下降,which points to reduced fibroblast matrix production if these cells do not sense SPP1.
Fig 4E: 人和小鼠AFib心房组织中胶原纤维形成通路都显著被富集。
This pathway-level interspecies correlation further bolstered the physiological relevance of the HOMER model while also underscoring inflammation and fibrosis as central processes in AFib.

感觉也没有做很多东西,机制也没怎么做,就单细胞看到了人和小鼠AFib心房里面SPP1巨噬增加,这群细胞可能通过促进心脏炎症和纤维化,影响了AFib的发生。2023年了这样做还可以发SCIENCE的嘛...
那就了解一下通讯大佬吧~哈佛的Matthias Nahrendorf教授

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