一. 关于conda/miniconda
conda相当于app store,最方便快捷的软件下载器,而日常生信使用Miniconda即可。
二. 下载Miniconda
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google “miniconda 清华”,可以看到miniconda有x86_64/x86两种版本。再输入命令行 uname -a查看服务器是多少位的,然后安装脚本 wget 复制下载链接https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh 到biosoft 目录
![安装脚本.png](https://upload-images.jianshu.io/upload_images/23650630-a9be3e7807173c5f.png?imageMogr2/auto-orient/strip%7CimageView2/2/w/1240)
安装miniconda
命令行 bash Miniconda3-latest-Linux-x86_4.sh 安装过程中,碰到版权信息,按enter键,碰到yes/no,输入yes,返回,直到安装成功。
接下来重要的一步就是激活conda,命令行 source ~/.bashrc
添加镜像 复制粘贴代码,再回车
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes
三.使用conda
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conda list 查看安装的所有软件列表
conda search fastqc 搜索conda软件,不过得等好久好久
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conda install fastqc -y 安装软件
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conda remove fastqc -y卸载软件