质粒(plasmids)是常用的一种载体(Vecto)，是做分子相关领域永远无法躲避的一道难题，不管做分子克隆，蛋白表达，包装病毒等等都需要用到质粒，所以当你开始一项课题或者实验的时候，第一步必然是深入了解自己所需要的质粒以及它的图谱结构。接下来我会对质粒的各个要素进行持续的讲解，如有遗漏，欢迎补充。
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质粒的基本概念和分类
质粒是生物细胞内固有的，能独立于寄主染色体自主复制，并稳定遗传的一类核酸分子。质粒常存在于原核细菌和真菌中，绝大多数为双链DNA(多数环状，现在也发现了有线性的)，少数为RNA型。
质粒的分类
1. 按照质粒在寄主细胞中的复制能力，分为严紧型质粒和松弛型质粒。
严紧型质粒：当细菌染色体复制一次，质粒也复制一次，每个细菌内包含1～2个质粒，所以严紧型质粒在扩增的时候得到的产量比较少，那你所得到的质粒浓度也会比较低，当你纠结为什么质粒浓度上不去的时候，不妨考虑一下是不是严紧型质粒导致的。低拷贝的质粒往往应用少，但是存在即合理，有些地方还是用的到的。一般分子量大的属于严紧型质粒。
松弛型质粒：当细菌染色体复制停止后仍然能继续复制，每一个细菌内含有20个左右的质粒，这些质粒的复制在寄主细胞的松弛控制下，每一个都能大量的复制，采取一定条件抑制蛋白质合成能增加质粒的扩增。松弛型质粒所得到的质粒含量和浓度就非常的大，能够满足正常实验的需求。
2. 按照质粒载体功能
克隆质粒载体：一般是高拷贝的就是上面讲的松弛型质粒，将需要的目的基因插入到质粒后倒入到细菌中，进行大量克隆扩增目的片段。
表达质粒载体：是指在克隆载体基本骨架上，加入一些表达元件等，使得插入的外源DNA(目的基因)在宿主细胞中复制，转录和翻译。
3. 按照进入受体细胞的类型
真核质粒
原核质粒
穿梭质粒是指能在两种宿主细胞内复制的质粒，只要是具有真核和原核两种不同的复制子。如下图pCMV6质粒所示，有ori和SV40ori两个启动子，很有可能就是穿梭质粒。
4 还有一些其他分类方法在这里就不阐述了。下面是简单分类的脑图，帮助快速查看。
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质粒的特征
质粒有两个比较有意思的特征，帮助我们加深对质粒的认识和理解。不知道你有没有想过一个细菌中能否存在别的质粒？质粒既然是环状DNA小分子，那它能不能在细菌之间进行转移？这就涉及到质粒的两个有趣特征。
1. 质粒的不相容性
同种或者亲缘关系比较近(比如利用同一复制系统)的两种质粒是不能稳定的存在一个细胞内。当一种新的质粒进入到含有质粒的细菌中时，若两种质粒同源或者近缘，他们会相互竞争资源，优胜劣汰。
2. 质粒转移性
质粒在自然条件下，可以通过特定移动基因的作用转移到新的寄主细菌中。目前实验室中的质粒基本上都含有筛选的抗性基因，有强大的抗抗生素能力，但是它缺少移动作用的基因，可以保证质粒不会扩散污染环境。最重要的一点：做完实验后，所有质粒实验相关的耗材，试剂，菌种，残留培养基都要进行灭菌处理！！这是作为一个科研人的基本素质，不能因为偷懒酿而成大错。
这期主要讲了拿到一个质粒之后，你要根据自己的目的来判断它是否符合自己的基本要求。比如需要松弛型还是严紧型，是需要克隆质粒还是需要表达质粒，是需要穿梭质粒还是仅仅原核/真核。这是学会查看图谱之前最基础的一部分，有的时候会起到意想不到的效果。
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