高精度空转的最后补充--目标细胞亚型的邻域通讯分析

作者，Evil Genius

高精度空转部分也全部结束了，这一篇做本部分的最后补充。

还是以王凌华文章为主要的参考

当然了，有的学员问可不可以人工圈选一个区域直接分析呢？

方法上可以，但是我们需要的是目标细胞亚型临近的通讯，我们以文章的分析为例

不同CAFs的邻域通过圈选的实现几乎是不可能的，还是需要分析的力量。

我们把分析步骤拆分一下。

第一步：指定目标细胞类型

第二步：分析目标细胞类型邻域的细胞barcode，也就是获得了目标细胞类型周围细胞的基因表达情况以及细胞“身份”

第三步：进行通讯分析。

我们来实现一下，全流程python代码,比较简单