土壤微生物，主要指的是生活在土壤中的细菌、真菌、放线菌、藻类的总称，它们是土壤不可或缺的重要组成部分。
土壤微生物发挥着两个主要的作用。一方面，它们是土壤的‘厨师’，它们的生命活动可增加土壤中氮、磷、钾等营养元素的供应，帮助农作物顺利地吸收这些营养元素。另一方面，它们又是土壤的‘医生’，对土壤进行‘解毒’和‘保健’，调控和维护土壤的健康质量，最终实现土壤的可持续生产力的提升。正是因为它们的存在，土壤才有了灵魂。
根瘤菌
根瘤菌能够吸收并固定大气中的氮，同时提供给植物作为肥料，还能吸收植物中的碳水化合物作为自身的营养。因此人们把豆科植物比喻成巧妙的生物固氮工厂。如果土壤中有了大量的根瘤菌，可少施或不施氮肥，还能提高土壤肥力，同时还能节约由于生产氮肥需要的电力以及减少水质和土壤的污染。
根瘤
每个根瘤都是一个小小的氮肥厂。有科学家推算豆科植物的氮肥厂比世界上任何一个氮肥厂的产量都要高得多。地球上根氨厂来生产这些氮肥，那么就得兴建87266个，可以设想根瘤菌每年为人类节省多少开支！瘤菌是一种常见的土壤微生物，当拔起豆科植物时，如大豆、紫云英，大家会发现这些植物的根部有一些小小的圆形颗粒，那些颗粒便是根瘤，根瘤里面就是根瘤菌。
根瘤与根瘤菌
每个根瘤都是一个小小的氮肥厂。有科学家推算豆科植物的氮肥厂比世界上任何一个氮肥厂的产量都要高得多。地球上每年由根瘤菌固定空气中的氮素相当于26180万吨硫酸铵氮肥提供的氮数量。如果设计年产量为3000吨的合成
