3、 Sheffle-LAGAN----完整序列的全局比对。它检测序列中的重排和逆序，同时产生一个全局的端到端映射图。如果你输入几个序列，所有成对的组合将被处理，结果将在VISTA中可视化。这是该服务器上唯一可用于检测重排和逆序的比对程序。（叶绿体基因组差异分析论文中好像一般都选这个）
Curve Parameters参数的意义：
- Calc Window:滑动窗口的大小，用来计算每个碱基对的保守值，这些值创建了VISTA曲线。默认是100个碱基对。
- Min Cons Width:保守区域在被绘制之前必须达到的最小宽度。默认值为100个碱基对。
- Cons Identity:必须在窗口(“Min Cons Width”)上保持的被认为是保守区域的最小百分比。默认值为70%。
- Minimum and Maximum Y：图的上、下边界。在低保守区域降低最小Y值将允许您看到这些较小的峰值。默认值为50%到100%。
- Curve Name：与该曲线相关的标签名称。
