肖卿馨醒来的时候，一眼就看出了这个医生是伪装的，她一伸手就抓住了医生的脖子，医生忙说道：“你就这么对待你的救命恩人？”肖卿馨一听是陈慎的声音就松开了手，陈慎说道：“如果你想知道我的秘密，你就跟我走。”这句话确实说到了肖卿馨的痛点，一是对于情报的敏感和好奇，二是对于自己能力的过度自信。肖卿馨说道：“如果让我知道你骗我，我可以随时要了你的命。”
于是两个人就穿着医护人员的伪装离开了医院，两个人来到北部山区的一个山洞里面，这个山洞已经被陈慎武装成了一个临时的基地，陈慎在基地里面给肖卿馨讲述另一个故事：首先陈慎大方的承认了杀了自己的导师，不过他说自己是不得已而为之，他的导师随便表面上个道德君子，但是实际上却是一个无恶不作的学术流氓，他一直在压榨陈慎和他的其他学生，直到陈慎发现了原子内部的世界，导师竟然想用人类世界的高能设备控制这个世界，成为这个小世界的神。
为了保护这个小世界的安全，陈慎以这个小世界全部的资料为诱饵，引导导师中了他的毒计。他故意露出破绽，暗示导师用校徽配制解密溶液，一旦导师这么做了，就会被有毒气体致死。肖卿馨之所以能保住一条命，主要是因为她吸入的气体量比较少，而且是实验结束时才吸入的。
至于后面的栽赃朴仁勇也是不得已而为止，因为陈慎必须要离开这个小岛，他发现这个小世界中人人友善事事公平，所以他要用从这个小世界学来的哲学，改造我们这个世界。
肖卿馨说道：“社会法则的优劣不是你我就能判断的，但是变革必然会带来流血和动荡，你最好断了这个念想，然后老老实实跟我走。”陈慎说道：“不，我需要你的帮助，我要让你亲自看看那个世界。”
