Linux环境下的软件安装
Linux的应用商店(生信领域)：miniconda
下载miniconda到服务器：miniconda清华
- cd~/biosoft: 登录服务器，进入biosoft目录
- wget+复制的下载链接
选中，鼠标左键点一下复制，右键点一下粘贴 - bash Miniconda-latest-Linux-x86 64.sh:开始安装
如后续失败，从这里重来。回车跳过版权信息，看到"Do you accept the license terms?[yes|no]",安装开始；看到"Thank you for installing Miniconda3!",安装成功 - 激活：source~/.bashrc
命令行输入conda，出现满屏信息说明成功
- 添加镜像：镜像网站即主网站的副本。conda在国外，国内下载软件速度很慢，从镜像网站下载可加快下载速度
使用conda
- conda list：查看当前服务器安装的所有软件列表
- conda install fastqc -y:安装过程中所有的问题都回答yes
- conda remove fastqc -y: 卸载软件
- conda info --envs: 查看当前环境
- conda create -n ABC python=3 fastqc trimmomatic -y: 建立一个名为ABC的环境
python3是被指定的版本 - conda activate ABC: 激活新环境
-
conda deactivate: 退出当前环境
3.png
