Linux环境下的软件安装

Linux的应用商店(生信领域)：miniconda

下载miniconda到服务器：miniconda清华

1. cd~/biosoft: 登录服务器，进入biosoft目录
2. wget+复制的下载链接
   选中，鼠标左键点一下复制，右键点一下粘贴
3. bash Miniconda-latest-Linux-x86 64.sh:开始安装
   如后续失败，从这里重来。回车跳过版权信息，看到"Do you accept the license terms?[yes|no]",安装开始；看到"Thank you for installing Miniconda3!",安装成功
4. 激活：source~/.bashrc
   命令行输入conda，出现满屏信息说明成功

• 添加镜像：镜像网站即主网站的副本。conda在国外，国内下载软件速度很慢，从镜像网站下载可加快下载速度

使用conda

1. conda list：查看当前服务器安装的所有软件列表
2. conda install fastqc -y:安装过程中所有的问题都回答yes
3. conda remove fastqc -y: 卸载软件
4. conda info --envs: 查看当前环境
5. conda create -n ABC python=3 fastqc trimmomatic -y: 建立一个名为ABC的环境
   python3是被指定的版本
6. conda activate ABC: 激活新环境

7. conda deactivate: 退出当前环境

   
   
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