通过BiocManager下载安装ggplot2和DESeq2

R语言之书：“每年大约有四个新版本的R，用于解决函数、兼容性问题和错误修复。最好保持最新版本。”

首先将R与RStudio更新至最新版本（2020.6.4我R用的4.0.0，RStudio1.3.959）。

输入旧命令：

source("https://bioconductor.org/biocLite.R")，结果显示：

bioconductor现在已经更新成BiocManager

按照提示去网站搜索https://bioconductor.org/install/

输入新命令：

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))

  install.packages("BiocManager")

BiocManager::install(version = "3.11")，结果显示：

ggplot2和DESeq2等都包含在内

尝试加载包：

library("ggplot2") 

library("DESeq2")都能成功！