中医讲究天人合一，其中最能体现的就是五运六气，五运六气是大自然气候变化运行规律，五运六气也是来源于天文和地理、以及对人体的统一。五运来源于天，六气来源于地，合起来叫做五运六气，因此有“人以天地之气生，四时之法成”的说法。
中医最初是通过天文历法来研究气候、物候和病候的，《素问·病能论》：“上经者，言气之通天也。下经者，言病之变化也。”此时中医的五脏，实则就是不同年份不同季节中的，同气候、物候一起的病候。《素问·六节藏象论》：“春胜长夏，长夏胜冬，冬胜夏，夏胜秋，秋胜春，所谓得五行时之胜，各以气命其脏。”特定的先天禀赋、特定的心神意志状态，与特定的气候，会产生特定的疾病。五运六气辨证，就是时间医学，其本质，按现代的说法就是生物钟。
五运来自于天上的五大行星，与河图的五行是一样的，五星产生五行，五行产生五运，六气来自于月亮 的节律，人体气的运动就要遵循五运六气规律，所以说，五运六气才有了判断人体生命节律的功能，这个就是天气和地气，阴阳之气互相交融所产生的气交的气化环境，而正是由于这个气交的环境，五运六气才有了判断人体生命节律的功能，地支记录了大地气候的温度，湿度，风力的变化，并记录了由这种变化而产生的五气分布规律，从这个排列规律中说明了地上五行之气对人体产生的影响，地球大气层属于地气的一部分，太阳和地球的相互作用，太阳发出光和热，为地球气候带来规律性变化。
五行是天上五星（木星又叫做岁星，火星又叫做荧惑，土星又叫做镇星，金星又叫做太白，水星又叫做辰星）运动而成。按照太阳系内行星的排列，地球位于金木水火这四大行星的中间，但在天干的五行性质排列中，本应地球属于的位置却被土星占据了，地球在五行的性质中，和土星的性质一样，同属于土，这样，土星不但表示自己的五行属性，同时也代表了地球的五行属性，因而也就有了五行的时间模型和方位模型。
五运与五大行星
中运是由五星运动节律造成的五气轮流统治，按照天干周期规律，每一统运之气要管辖一年时间，由于太阳不停运动的原因，每一年的统运之气都要发生相应的变化。这种内部的变化状态，同样也会产出五行性质，人们按照统运之气在运动中发生变化所制造出来的性质特征，将它划分为五个不同时段，按照顺序，这五个时段分别称为初运、二运、三运、四运、五运，由于金气、木气、水气、火气、土气轮流各占一运，所以这个五运也分别体现为金运、木运、水运、火运、土运。 根据五星离地球的远近，产生了中运的太过和不及，离得近就是太过，离得远就是不及，根据五行的太过不及产生了十天干。
根据五大行星的影响，古人创造了天干系统，有阴干与阳干，阳干表示太过，阴干表示不及，而且产生了五行的概念，五行也容纳在天干里面。
如果十天干代表天气，那么地气的十二支则是根据月球围绕地球转十二圈得来的。天气下降为五行，地气中风、寒、暑、湿、燥、火上升到天，化为三阴三阳，这就是天气下降，地气上升，在气交形成不同比例，根据每年不同，干支所形成的天气与地气也有不同的组合，这些组合恰好有六十个，所以称为六十甲子，就是天气与地气之间谁多谁少的混合的结果，天气以六十甲子为周期，循环变化，所以天干地支的实质不止是用来记录时间的，更重要的是记录 天气与地气的状态。这种混合状态就形成了地上的气候特点，这种气候特点对人体也发生了相应的影响，这种影响就是人体内部气的化身。
月相的变化与十二地支
一年中月亮绕地十二周，故有十二地支，地支表示地气，换句话说，天干和太阳有关系，地支和月亮有关系，也就是说，天干是太阳的节律，地支是月亮的节律，那月亮就代表阴，一年当中，月亮围绕地球转12周，这就是十二地支的来源，它就形成了地上六气的变化，六气的变化就是地上的气化节律，也就是说，地支揭示的实际上是地气的运动规律，所以说运气七篇所讲的内容才叫做五运六气。
地气的五行性质，是地球吸收太阳的光和热后，由大气层与地表层的温度变化共同产生，无论是年支，月支，日支，时支，体现的都是大气层温湿度与地表层温湿度相互作用过程规律，由于月支与时支的变化程序最为明显，最容易为人们感受和认识，只要认真的了解月与时的地支变化，就可以从中认识年支与日支的相应变化过程。
年支的程序表达了一个12年为周期的五气循环过程，日支的程序表达了一个以12天为周期的循环过程，由于地气的产生主要来源于太阳的光和热，远古的时候，就已经发现了地球对太阳能量的吸收并不是每一年都等量相同，而是有多有少，存在有一个以十二年为周期的量变过程，地球每一年吸收的太阳能量也在发生变化，同样以12天为周期的量变过程。
此后，把任何时间尺度的周期，都分成若干阶段，比如人的一生生长老已，一年生长收藏，一日昼夜旦夕。
中医五行的本质是也是生物钟，二十四节气是生物钟的具体表述，比如节气惊蛰，指的是蛰虫惊而出走，一候桃始华，二候黄鹂鸣，三候鹰化为鸠，就是桃花开始开放，黄鹂开始鸣叫，指的是大自然的生物的生物钟的运转，通过生物钟将五行、二十四节气、甚至阴阳联系在一起，无论用什么方式，讲的都是一件事情，就是自然界万事万物的规律。
因此无论用的那种算法，讲述的都是太阳系的春夏秋冬，万物的升降沉浮、生老病死，因此万物相关，万物互联，这些方法都成为中医的基础理论，指导着中医更好的从宏观到微观，从宇宙到个体，更好的观察自然的变化规律对人体的影响，来更好的治疗疾病。
