1.关于linux及服务器
linux是一种独立于Windows和macOS的操作系统，具有开源、免费以及安全稳定等优点。目前个人用户较少，主要应用领域在服务器上。
2.为什么生信要用linux
生物软件基于linux，系统开源、免费，不需要图形界面，有效节约资源。可以批量高效的处理文件以满足数据分析的需求。
3.怎么召唤linux
mac端无需安装软件，使用原生terminal即可；服务器可以选择本地服务器或云服务器。
4.使用terminal登陆服务器
mac系统可以使用terminal来登陆服务器。打开Mac terminal,输入ssh bio02@122.51.158.112回车后弹出是否确定继续链接，type yes。
成功登陆ubuntu
5.linux基本操作练习
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pwd: print working directory (显示当前路径)
显示当前路径 -
mkdir: make directory (创建自己的目录)
#生信软件 mkdir biosoftware
#数据 mkdir data
#临时文件 mkdir tmp
#源代码 mkdir src
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ls: 显示列表，将文件和目录一一显示
ls显示列表 -
rm、rmdir、rm -r
1.rm+文件名 对应删除文件
2.rmdir+文件名 对应删除空目录
3.rm -r+文件名 对应删除非空目录
4.rm -rf 樯橹灰飞烟灭（慎用，会删除服务器上个人的全部文件）
练习删除命令 -
cd：cd+文件名进入目录
cd -: 返回上一次操作目录
cd: 主目录
练习 -
vi: 新建脚本或文本文档（vi为linux系统下的文本编辑器）
cd tmp
vi hello_linux.txt
# type " i " to edit 进入编辑模式
Esc #退出编辑模式
:x #保存并退出文本编辑器
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cat: 查看编辑内容并输出
head: 输出前10行
tail: 输出后10行
-n: 自定义输出的行数 （head -n 5 hello_linux.txt）(可以利用tab键快捷键入，类似R)
查看文本命令 -
cp: 复制文件
cp 文件1 文件2 (文件2为文件1的copy,可以直接用新的名字)
复制并重命名copy文件 -
mv: 将文件移动入文件夹或者重命名
mv file directory
移动文件 -
ls -al: 以长列表形式显示所有目录及文件详细信息
（1）第一列drwxr-xr-x 代表文件的类型及权限。d开头表示为文件夹；-开头表示文件；l开头为连接文件
（2）第二列为文件的链接数
（3）第三、四列为拥有文件的用户及组
（4）第五列为文件的大小
（5）第六列为文件最后修改时间
（6）第七列为文件名
ls -al -
ls -s: 可以在每个文件名后输出该文件的大小 -
mkdir -p: 可以创建多级目录
mkdir -p tmp/tmp1/tmp1.1
ls -R使用这个命令来查看目录的层级关系
ls -R命令 -
rm -r: 连同root目录下全部删除
image.png -
cat /proc/cpuinfo | grep 'model name' |uniq: 查看CPU型号
cat /proc/meminfo | grep MemTotal: 查看内存
fdisk -l | grep Disk: 查看硬盘大小（在此服务器下，查询失败）
cat /proc/cpuinfo | grep "cpu cores" | uniq: 查看CPU核数
cat /proc/cpuinfo | grep "physical id" | uniq | wc -l：查看CPU个数 faith默默
内容来源--微信公众号生信星球
