1.了解conda
2.使用服务器下载、安装和配置miniconda
3.使用miniconda查看、搜索、卸载软件
3.1conda list
,用来查看当前服务器上安装的所有软件列表
3.2conda search fastqc
,在conda中搜索数据质控软件fastqc
3.3conda install fastqc -y
,在conda中安装fastqc。-y是yes,表示安装过程中conda问的问题全部回答yes
3.4conda remove fastqc -y
,卸载软件。
4.定制conda的分身
4.1conda info --envs
,查看当前conda有哪些环境
4.2conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y
,可用来创建一个名叫rnaseq的conda环境,用于处理转录组数据
4.3conda deactivate
,用于退出当前环境
day3-linux环境下的软件安装.png