跟着Cell Research学单细胞分析:箱型图、小提琴图、误差棒,总有一款适合你

联系转录组特征和表型特征是非常常见的操作,这次的视频,我以文献中一个小图为例,讲解了在均值比较中常见的箱型图、小提琴图,以及几种变形。视频已经上传B站,这是链接:跟着Cell Research学单细胞分析:箱型图、小提琴图、误差棒,总有一款适合你_哔哩哔哩_bilibili

视频中涉及到的知识点包括:

  • 分组箱型图/小提琴图/条形图/误差棒
  • 均值比较,p值计算,在图形中添加p值
  • 小提琴图组合箱型图
  • 小提琴图组合竖直线段
  • 添加阴影效果

相关代码可以在我公粽号后台回复20220112获取

1. 文献原图
2. 添加显著性标记/星号
3. 条形图+误差棒
4. 小提琴图组合箱型图
5. 小提琴图组合竖直线段
6. 添加阴影
参考

本期图形总结,参考了以下帖子:
[1] 一文搞定ggplot2图像添加阴影——公粽号:R语言数据分析指南
[2] Fancy violin——公粽号:医学僧的科研日记
[3] https://stackoverflow.com/questions/35717353/split-violin-plot-with-ggplot2
[4] https://stackoverflow.com/questions/47651868/split-violin-plot-with-ggplot2-with-quantiles
[5] https://github.com/openbiox/UCSCXenaShiny/blob/master/R/GeomSplitViolin.R

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