PCA(主成分分析)算法

因为对PCA算法的好奇,所以就写一篇笔记记录一下自己学习的过程。

一、简介

在现实生活中,我们人类总会存在一种这样的习惯:关注自己所关心的,与此同时会忽略掉自己所不关心的事情。就像看一场足球比赛一样,我们面对的显示屏幕包含了几十万个像素,那么这其中的人或者球只占了其中的一部分,那么我们自然而然的会对我们的屏幕中的像素进行降维处理,只关注其中的人和球的像素就可以了。不过即使仅仅只面对人和球的像素,我们仍然还有很多信息要进行处理,但是正如AI教父Hinton所说的那样:“人也是机器,绝妙的机器”,我们的大脑采用了一种更为有效的方式来处理这些数据,也就是将其转换为一个三维图像。在这个过程中,我们就已经将显示屏中的几十万个维度最终转换为一个三维数据。当然转换的前提肯定是数据之间具有一定的相关性,这才能让我们实现这个转换过程,这也就是我们经常会提到的数据降维。

PCA算法就是一种很典型的一种降维方法,在PCA中,其将数据从原来的坐标系转换到了新的坐标系下,在这个转换过程中,我们就需要为原始数据构建一个超平面。那么这个超平面就需要有下面这两个性质:
1、最近重构性:也就是样本点到这个超平面的距离足够近。
2、最大可分性:样本点在这个超平面上的投影能尽可能的分开。

如果想深入了解这两个性质,可以去查找《机器学习》、《【机器学习】【白板推导系列】》视频等相关资料进行学习。

二、代码实现

2.1 实现步骤:

1、对所有样本进行中心化,其实也就是将原始样本减去其质心\bar{x}进行平移。
2、计算样本的协方差矩阵Cov(\frac{1}{m}XX^T)。
3、对协方差矩阵Cov进行特征值分解,并按照特征值从大到小排序,取前k个特征值所对应的特征向量组成低维超平面。

2.2实现代码

#-*- coding=utf-8 -*-
#@Time : 2020/9/24 20:30
#@File : PCA.py
#@Software : PyCharm

from numpy import *
from tkinter import filedialog
import matplotlib.pyplot as plt

"""
函数说明:加载数据集
"""
def loadDataSet(delim='\t'):
    dlg = filedialog.askopenfile(title='打开文件', filetypes=[("文本文件", "*.txt"), ('Python源文件', '*.py')])
    fileName = dlg.name  # 获取数据文件路径
    fr = open(fileName)
    stringArr = [line.strip().split(delim) for line in fr.readlines()]
    fr.close()
    # datArr=[line for line in stringArr]
    return mat(stringArr).astype(float)

'''
函数说明:PCA方法使用
'''
def PCA(dataMat,topNfeat=9999999):
    meanVals=mean(dataMat,axis=0)
    meanRemoved = dataMat - meanVals    #中心化
    covMat = cov(meanRemoved , rowvar=0)        #建立协方差矩阵
    eigVals,eigVects = linalg.eig(mat(covMat))      #求解特征值和特征向量
    eigValInd=argsort(eigVals)      #对特征值进行排序
    eigValInd = eigValInd[:-(topNfeat + 1):-1]
    redEigVects = eigVects[:,eigValInd]     #获取前k个特征向量,组成投影矩阵
    lowDDataMat = meanRemoved * redEigVects     #进行投影转换
    reconMat = (lowDDataMat * redEigVects.T) + meanVals

    return lowDDataMat, reconMat

'''
函数说明:显示数据
'''
def ShowData(dataMat,lowMat,reconMat):
    fig = plt.figure()
    ax = fig.add_subplot(111)
    ax.scatter(dataMat[:,0].flatten().A[0], dataMat[:,1].flatten().A[0],marker='^',s=90)
    ax.scatter(reconMat[:,0].flatten().A[0],reconMat[:,1].flatten().A[0],marker='o',s=10,c='red')
    # ax.scatter(lowMat[:,0].flatten().A[0],lowMat[:,1].flatten().A[0],marker='o',s=50,c='blue')

    plt.show()

'''
函数说明:主函数
'''
if __name__ == '__main__':
    dataMat = loadDataSet()
    lowMat ,reconMat = PCA(dataMat, 1)
    ShowData(dataMat,lowMat,reconMat)

实现效果:


三、小结

PCA算法的实验过程可能相对简单,不过其是一个经典的降维方法,主要也被用于数据的压缩和坐标转换这两个方面。当遇到特征个数过多或是想要提高算法效率的情况时,可以考虑使用该方法来将原始数据降维处理,更多的用法还需要日后更为深入的学习了解。

参考资料:《机器学习》《机器学习实战》

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