使用TBtools 从基因组提取DNA序列

需求:想要查看一个基因的直系同源基因在不同物种的区别,如上游启动子区,3端-UTR 区域,CDS区

比如我有一个大蒜基因Asa7G00205,


image.png

1输入基因组序列
2设置输入序列
根据基因组GFF文件 这个基因的位置如下:
chr7 EVM gene 81790460 81791328 . - . ID=Asa7G00205

所以设置如下,同时将上下游2000bp 提取出来
chr7 81788460 81793328

有的时候基因组并不是chr1 开始,如芦笋基因组是NC_033794.1 编号
就需要设置如下: NC_033794.1 81788460 81793328


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