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  • 生信软件的使用:fastacmd的提取较大基因组序列

    写在前面: 最近要将参考基因组(4.1G,粗山羊草)的每一条染色体单独提取出来,之前我写过一个使用faSomeRecords的帖子基因组学5-利...

  • 生信软件的使用:bwa-mem2小测试

    写在前面 最近在利用小麦的重测序数据进行mapping,小麦是一个很奇特的物种,六倍体,有ABD三个基因组,基因组大小约为17Gb,因此,制约小...

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    基因组学5-利用faSomeRecords根据基因ID提取基因序列

    安装 从该网址下载其安装脚本:http://hgdownload.cse.ucsc.edu/admin/exe/linux.x86_64/ 我一...

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    生信软件的安装1-SRAtoolkit

    写在前面 最近服务器的我最常用的那个节点又坏了,那个环境我搭建的很好,几乎所有数据和软件都在那上面。但是,无奈之下只能换到另一个节点,一切都要从...

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    单个基因的生物信息学分析(2)-蛋白质结构域预测

    本期的主题仍然属于《单个基因的生物信息学分析》,主要讲解介绍一下单个蛋白质结构域分析。 网站链接如下:InterPro 打开主页面显示如图1,注...

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    单个基因的生物信息学分析(1)-基因结构与功能分析

    在生物学分析中,我们经常会针对某个基因进行生物学功能分析,比较常见的包括基因结构预测,功能注释,蛋白质结构域预测(跨膜域,信号肽),同源基因分析...

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    植物基因组学-fastp进行高通量测序数据的质控

    对于各位小伙伴来说,无论是自己独立进行高通量测序数据分析,还是解读公司的测序结果,一个必须要面对的情况就是高通量测序数据的质量控制,又称Qual...

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    植物基因组-基因组分析中的“地图”文件(gff3和gtf文件介绍)

    常见的生物信息分析中,基因组的注释文件和参考基因组具有相同重要的功能,如果说参考基因组是一个蕴含着所有资源的宝岛,那么基因组的注释文件就是航海路...

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    植物基因组学-专属于小麦的测序数据库IWGSC

    今天将为大家介绍小麦的特有的生物学网站,该数据库是由国际小麦基因组测序联盟(International Wheat Genome Sequenc...

个人介绍
中国农业科学院 生物学博士在读