药怎么合成出来的,这事儿太重要了! 它直接关系到这药能不能顺利生产、成本高不高、质量安不安全稳不稳定,以及最后能不能上市卖。整条研发到生产的路子都靠它,还影响研发速度、成本、专利保护,甚至仿制药能不能做出来。说白了,这药能不能从实验室真正用到患者身上,合成方法是关键。那我们如何知晓某药物分子的合成方法呢?
因此,笔者将在下文中介绍如何查询药物分子的合成方法,以助力药物筛选和研发的顺利推进。
①摩熵化学数据库检索
摩熵化学MolAid拥有超过7000万条反应数据。可结合丰富的物质角色、反应条件、产率、溶剂、催化剂等筛选项,对结果集精确筛选获得理想反应条件。反应数据支持溯源,完整的参考文献信息可追溯到原文,方便我们参考,实现反应创新、优化合成线路。
值得一提的是,摩熵化学MolAid还有个逆合成分析功能。它是从产物(目标分子)出发,逆向推导出可能的合成路径和原料的方法。这种方法通过逆向思维,将复杂的合成问题分解为一系列相对简单的步骤,从而找到最优的合成路线。
如搜索药物名称“阿司匹林”(如下图),可通过在首页输入该物质的名称,也可以输入英文、CAS号、InChi等化学编码进行检索。并且还支持自行绘制结构式进行检索。该物质的查询结果,包含概况、分类、物化性质、计算性质、ADMET、药理毒性、反应信息、谱图信息、晶体信息、生物学信息等模块。而在这里我们需要查看“反应信息”。
在左侧条件筛选里,还能够通过筛选物质角色、反应时间、反应条件、反应物、产物等方面来进行更精确的搜索,更快捷的找到反应中适用的化合物。可以对自己感兴趣的反应信息进行收藏,只需点击反应信息右侧书签标志即可,并且支持导出。
在搜索结果栏里,我们可以看到这些反应的反应结构式、反应详情等内容。反应详情包括产率、时间、温度、压强、添加物/添加剂、参考文献等。在参考文献处,可快捷筛选类型,即文献、专利信息。并且大家可以根据需求,自定义排序。点击文献名称或↗️,可以查看参考文献名称、DOI、发布年份、期刊等内容。点击右上角的“引用”,便会跳出标准的引用格式。
专利类文献的话,可以查看专利名称、申请人、公开号、公开(公告)日、摘要等信息,并且点击“查看原文”,即可在线查看专利原文并且还支持下载哦。
②其他专业化学合成数据库
例如CAS SciFinderⁿ、Reaxys 或 PubChem等,这些数据库集成了海量期刊和专利文献,能迅速返回包含该分子具体合成路线的原始文献,并提供详细的反应步骤、条件、产率和参考文献。
③查阅近期综述性文章和高影响力期刊论文
在 Web of Science、PubMed 或 Google Scholar 等平台上搜索该药物分子名称加上关键词如 “synthesis review”等,查找近期的综述文章,这类文章通常会总结和评价已有的各种合成路线;同时关注一些发表在高影响力期刊上的原始研究论文,它们往往报道最新或最优化的合成方法。
④参考权威有机合成参考书籍和专著
查阅如《Comprehensive Organic Synthesis》、《有机合成事典》或针对特定类型药物(如抗生素、抗癌药)的合成专著,这些书籍通常由专家编纂,系统收录了重要分子的经典或代表性合成方法,信息可靠且经过一定筛选,虽然时效性可能略逊于数据库和最新文献,但对理解核心路线非常有价值。
⑤分析结构相似分子的已知合成路线
如果目标药物分子是新颖的,可尝试在数据库中检索其核心骨架、关键中间体或结构高度相似的已知化合物(类似物或前体)的合成方法,通过分析这些相似分子的合成策略(如关键键的形成、官能团转换、保护基策略),结合逆合成分析,如摩熵化学MolAid的逆合成功能,可以推导或设计出目标分子的可能合成路径,这常是创新药物分子合成研究的起点。
⑥系统检索相关专利文献
使用专利数据库进行检索,药物研发公司通常会在专利中详细披露其合成工艺(包括具体步骤、反应条件、纯化方法和产率),这些信息往往是工业级生产方法的直接来源,具有极高的实用价值,但需注意专利语言的解读和权利要求范围的区分。
这些信息能帮助实验人员提高设计合成方法的效率、减少实验风险,同时也为教育工作者和学生提供了丰富的学习材料,并且能够帮助相关企业优化生产流程,开发新产品,提高硬实力。