PyMol 命令是由关键词(keyword)和变量(argument)组成
quit #退出PyMol程序
zoom #对图像进行放大
fetch #从PDB数据库进行加载蛋白质结构，[fetch 6V0H] (不需要添加后缀.pdb)
load #在本地加载蛋白质结构 load 需要添加后缀.pdb
hide #对加载的结构进行隐藏(没有删除),可以隐藏显示模式 [hide cartoon,6V0H]
delete #将加载的结构进行删除 [delete 6V0H]
show #显示结构形式，可以是卡通模式(cartoon) [show cartoon,6V0H]
将蛋白质按照不同的二级结构显示颜色：
color red,ss h #将蛋白质结构中的helix显示为红色
color cyan,ss l+ #将蛋白质结构中loop，以及除bete sheet和helix以外的地方显示为浅蓝色
color green,ss s #将蛋白质结构中bete sheet显示为绿色
select MCE,sele #将选择的蛋白质结构区域重新命名为MCE
color cyan,MCE #将蛋白质MCE区域显示为cyan(颜色)
hide cartoon,MCE >> show sticks,MCE #将MCE区域转换为球棍模型显示
bg_color white #把背景变为白色
