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相分离研究入门（一）：如何从序列特征预测你的蛋白能否发生相分离？引言 液-液相分离（LLPS）火了十多年，从最初的“无膜细胞器怎么来的”，到如今渗透进转录调控、应激颗粒、神经退行性疾病、肿瘤等几乎所有热门方向...
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植物相分离研究：B-isox MS技术从相分离蛋白库中找到你的下一个课题引言 前阵子我在翻文献的时候，发现了一个特别有意思的现象：相分离 这个词在动物细胞生物学圈子已经火了好几年了——从应激颗粒到转录凝聚体，从神经退...
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【药物靶点筛选】如何判断药物靶点是被抑制还是被激活引言 在靶向药物发现中，筛选到一个候选化合物与目标蛋白结合的信号之后，面临的核心问题往往是：这个化合物到底是激活（激动剂/活化剂）还是抑制（拮抗...
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【药物靶点筛选】如何根据你的研究基础选择靶点发现思路？引言 在广阔的药物研发领域，万事开头难。无论是学术界的科研人员还是工业界的研发者，课题的核心始终围绕着疾病、靶点和药物这三大基本要素展开。 如何...
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蛋白互作实验 | WB验证成功但IP-MS查不到诱饵蛋白的深度排查思路引言 在蛋白质互作（PPI）研究中，免疫沉淀-质谱联用（IP-MS）是我们最依赖的核心武器。 但很多研究者都经历过这样一个令人崩溃的“至暗时刻”...
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蛋白翻译后修饰搜库策略对比：Closed / Open / Offset Search如何根据科研问题具体的应用引言 同样是搜库，为什么别人能挖出更多修饰？在上篇中，我们系统剖析了ClosedSearch、OpenSearch和OffsetSearch这三...
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蛋白翻译后修饰搜库策略对比：Closed / Open / Offset Search有何区别？引言 同样的质谱数据，用MaxQuant只鉴定到几个磷酸化位点，换用其他引擎却能挖出数十种修饰——差异不在软件本身，而在检索策略。鸟枪法蛋白质组...
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【液-液相分离研究】三大蛋白质组学技术如何高效分离与鉴定相分离蛋白引言 做相分离研究，最让人头疼的问题往往是第一步：我该从哪里下手找到那些真正参与相分离的蛋白？ 液-液相分离（LLPS）作为细胞内无膜细胞器形成...
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「分子对接/分子动力学模拟」如何寻找蛋白-配体相互作用中真正的“关键残基”引言 如果你做过蛋白-配体研究，大概率经历过这种场景：对接做完，盯着3D结构，看到配体周围有几个残基——氢键、疏水作用、π-π堆积都有。于是论文...