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激酶药物研发新策略：化学诱导接近（CIP）如何通过抑制性磷酸化关闭致癌BCR-ABL引言 近期读到一篇刚发表在ACSCentralScience上的文章，思路让我眼前一亮。 传统的激酶抑制剂，无论是ATP竞争性抑制剂（如伊马替尼...
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相分离数据库实操指南③：如何利用PhaSepDB 3.0全面挖掘相分离蛋白的功能、调控与疾病关联？引言 前两篇我们分别拆解了PhaSePro（脚手架蛋白金标准数据库）和LLPSDBv2.0（体外实验条件宝库）。前者帮你确认“哪些蛋白是已知的驱...
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AP/IP-MS、PL-MS与XL-MS在「解构蛋白复合体组成」中的作用与选择引言 解析蛋白复合体的组成、动态变化和空间结构，已成为蛋白质组学和结构生物学领域的核心命题。研究者通常需要回答三个核心问题：复合体里到底有哪些成...
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蛋白翻译后修饰互作组学：把修饰肽段作为诱饵的非常规质谱方法引言 大多数课题组做IP-MS的思路是：拉一个蛋白看谁和它结合。然而，这种结果往往被细胞内丰度极高的组成型互作所主导，那些依赖于特定翻译后修饰（...
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相分离数据库实操指南②：如何利用LLPSDB v2.0查找体外相分离实验条件与相图数据？引言 上篇我们详细拆解了相分离领域的“金标准”数据库PhaSePro，学会了如何查找已被文献报道的驱动蛋白（脚手架蛋白）。但实际科研中，仅仅知道...
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相分离数据库实操指南①：如何利用金标准数据库PhaSePro寻找已有文献报道的驱动蛋白？引言 上篇我们系统盘点了相分离研究四大主流数据库的定位与特色，并厘清了“脚手架蛋白”与“客户蛋白”这对关键概念。但光知道定位还不够 ——如何真正...
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四大相分离研究数据库盘点：PhaSePro / LLPSDB v.2.0 / PhaSeDis / PhaSepDB引言 液-液相分离（LLPS）已经成为细胞生物学领域最令人兴奋的研究方向之一。从核仁到应激颗粒，从转录调控到信号转导，蛋白质和核酸通过相分离自发...
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蛋白互作干货：免疫沉淀质谱（IP-MS）实验中的三种对照组设置方案引言 在现代高深度蛋白质组学研究中，免疫沉淀-质谱联用技术（IP-MS）已成为解析蛋白质-蛋白质相互作用（PPIs）的“金标准”。 然而，这项技...
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从两篇Cancer Cell经典研究分析：如何寻找细菌-宿主互作的关键分子对引言 在抗菌药物研发中，如何精准找到细菌入侵的“钥匙”？益生菌的健康益处，究竟由哪个表面蛋白与肠道上皮“对话”？肿瘤微生物组里，特定细菌又是通过...