引言 后基因组时代，功能蛋白质组学的核心已从单纯的蛋白鉴定，转向对蛋白质分子社交网络的精细解析。对于手握未知功能靶蛋白的研究者而言，最关键的疑问莫过于：它究竟通过何种方式“对...
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【蛋白互作研究】如何精准区分RNA/DNA/蛋白互作模式 -
【蛋白互作研究】APEX与BioID邻近标记技术（PL-MS）终极对比：速度与毒性的权衡如何选择？引言：速度与毒性的两难抉择 上一篇《邻近标记质谱技术PL-MS的十年探险之路-知乎》我们见证了BioID技术的诞生——它像一把“分子喷漆罐”，解决了传统方法无法研究难溶蛋白和...
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邻近标记质谱技术PL-MS的十年探险之路细胞，这个生命的基本单元，内部藏着无数未解之谜。蛋白质作为生命活动的核心执行者，它们之间的相互作用就像一场精密的“分子对话”。然而，在邻近标记（PL）技术出现前，我们只能借助...
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捕获罕见“激活信号”：热蛋白组分析TPP技术破解酶激活剂筛选的百年困局如果把药物研发比作一场狩猎，那么“酶抑制剂”就是漫山遍野的兔子，而“酶激活剂”则是那只传说中罕见的独角兽。 在过去几十年的药物化学教科书里，我们习惯了“阻断”、“拮抗”、“抑...
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深度解析：RNA结合蛋白的纯化提取与功能筛选前沿进展引言 长期以来，RNA结合蛋白（RBPs）研究被戏称为“贵族实验”。经典的RIP（RNA免疫沉淀）或CLIP-seq技术，虽然经典，却有着令人望而却步的门槛：起始细胞需求量大...
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热蛋白组分析TPP-PISA | 从器官特异性到老药新用的技术赋能引言 在药物研发的早期筛选中，我们习惯了依赖HeLa、HepG2这些经典的“全能”细胞系。但我们不得不面对一个房间里的大象：细胞系不仅代表不了人体，甚至代表不了器官。 近日，...
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Nature访谈：蛋白设计只靠AI到底够不够？来听听西湖大学卢培龙等三位大佬怎么说引言 AlphaFold 3 和 RoseTTAFold All-Atom 的出现，让我们觉得自己手里拿着一把能解决所有问题的锤子。但在顶尖结构生物学家眼里，这把锤子还不够完...
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CETSA实验避坑手册：WB高背景、熔解曲线问题及 CETSA-MS的进阶应用引言 接触细胞热位移分析（CellularThermalShiftAssay，CETSA）实验以来，从最初的手忙脚乱到逐渐熟练上手，其间踩过不少坑，也从ResearchGat...
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热蛋白组分析升级：从高丰度“无效修饰”中精准捕获功能性蛋白修饰位点引言：高丰度陷阱下，功能修饰位点何处寻？ 质谱仪一跑，数万条修饰位点数据瞬间到手，可屏幕上密密麻麻的修饰记录，到底哪些才是真正能调控蛋白质功能、影响细胞生理活动的“关键选手”...
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热邻近共聚集技术升级 | Slim-TPCA 实操指南：一篇教你如何用三个温度点筛选互作蛋白前言 宝子们做互作蛋白筛选时，是不是被传统 TPCA 的 “10 个温度点魔咒” 劝退过？样品要得多、批次效应难控制、数据分析耗时长，想快速拿到可靠结果简直难上加难！ 好在 ...
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从 IJBS 案例到 Nat Commun 方法论：热邻近共聚集TPCA 技术在天然产物中的保姆级攻略前言 提到无标记靶点发现技术，大家对CETSA（细胞热位移分析）和TPP（热蛋白质组分析）这对科研孪生技术的原理一定不陌生：“配体结合改变稳定性”——当药物与靶蛋白结合后，会...
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【超硬核干货】新手入门蛋白质组学：从原理到实操，一篇搞定引言：为什么基因组不是生命的全部？ 每个人的DNA序列基本固定，为何细胞功能千差万别？为何许多疾病查基因却找不到病因？ 答案在于：蛋白质 —— 生命活动的实际执行者。 如果把...
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小分子靶点筛选指南：蛋白芯片、SPR、TPP、LiP-MS的实战选择引言 做小分子靶点筛选这么多年，最深的感悟是：选对技术能少走一半弯路。靶点筛选作为新药研发的“敲门砖”，精准锁定药物作用的生物靶标，直接决定了后续化合物优化的方向和临床试验的...
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靶点验证四步走（四）｜技术创新与合规考量：黑科技提效 + 红线护航，解锁靶点落地最后一公里引言 哈喽～小谱的实验笔记准时上线！昨天咱们刚闯过成药性评估的“落地资格考”，成功把靶点从 “功能有效” 稳稳推向 “药物可用”，不少科研 er 留言说 “终于能看到靶点变药...
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CETSA 实战指南：从原理到热蛋白组分析升级，解锁靶点验证 + 脱靶分析双重技能引言 从癌症药物研发到天然产物靶点筛选，从炎症机制研究到蛋白功能解析，细胞热位移技术（CETSA）早已成为跨领域的靶点验证 “利器”——它最大的优势的是无需纯化蛋白，直接在细...
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靶点验证四步走（三）｜成药性评估：从“功能有效”到“药物可用”，避开药物开发陷阱引言 哈喽～小谱的干货实验笔记准时上线！昨天咱们刚闯完《靶点验证四步走》的第二关 —— 体内外模型：给靶点做 “活体模拟考试”，筛掉 90% 的伪靶点！[https://ww...
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Science资讯 | meTPD 颠覆传统，蛋白质组学如何破解“不可成药”难题？引言 上个月《Science》重磅发布：跨膜与胞外空间靶向蛋白降解（meTPD）概念应运而生，一举打破经典靶向蛋白质降解（TPD）仅能作用于胞内靶点的局限！这一整合了 TPD...
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基于TPP热蛋白组分析的毒理研究启示引言 一种抗癌药能治好骨髓瘤，却意外引发甲状腺功能减退；发霉玉米的毒素明明攻击 DNA，却会导致急性肝坏死；阿片类毒品成瘾后，戒断反应的根源远不止多巴胺受体脱敏…… 在药物研...
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靶点验证四步走（二）｜体内外模型：给靶点做 “活体模拟考试”，筛掉 90% 的伪靶点！引言 哈喽～小谱的笔记准时炸干货！昨天咱们搞定了《靶点验证四步走》的第一关 —— 靶点功能验证，用 “基因敲除 + 蛋白通路 + 人群数据” 三招，把一堆 “差异信号” 筛成...