44.5分顶刊发文,单细胞鉴定出乏氧巨噬细胞进行后续研究。前有衰老CD8T,现有乏氧巨噬。识别某种表型的XX细胞可发高分文章!

01一、文章信息

发表杂志名称:Cancer Cell

中文标题:鉴定胶质母细胞瘤中具有血管正常化治疗潜力的乏氧巨噬细胞

英文标题:Identification of hypoxic macrophages in glioblastoma with therapeutic potential for vasculature normalization

影响因子:44.5

发表日期:2024 年 5 月 13 日

01二、研究概述
作者针对 51 例弥漫性胶质瘤患者(含 40 例 IDH 野生型胶质母细胞瘤、8 例 IDH 突变型星形细胞瘤、3 例 IDH 突变型少突胶质细胞瘤)及 12 例小鼠胶质母细胞瘤样本展开研究,运用单细胞转录组学、空间转录组学等技术,解析单核细胞来源肿瘤相关巨噬细胞(Mo-TAMs)的异质性。研究鉴定出 6 个功能与空间离散的 Mo-TAM 亚群,重点聚焦乏氧巨噬细胞(Hypoxia-TAM),发现其受肿瘤坏死区乏氧微环境诱导,通过分泌肾上腺髓质素(ADM)破坏血管内皮黏附连接,导致肿瘤血管高通透性。进一步实验证实,基因敲除 ADM 或使用 ADM 拮抗剂(AMA)可恢复血管完整性,提升抗瘤药物(如达拉菲尼)在肿瘤内的浓度,延长荷瘤小鼠生存期,且 Hypoxia-TAM 比例或 ADM 高表达与胶质母细胞瘤患者不良预后相关,为胶质母细胞瘤治疗提供新靶点与策略。

01三、研究结果

(一)图 1:人弥漫性胶质瘤中 Mo-TAMs 的单细胞图谱

作者获取 51 例人弥漫性胶质瘤及 12 例小鼠胶质母细胞瘤样本的单细胞 RNA 测序(scRNA-seq)数据,对髓系细胞组成及 Mo-TAM 异质性进行分析,肿瘤样本涵盖不同类型且部分位于大脑不同脑叶。通过无偏聚类和细胞谱系注释,作者识别出 360214 个单细胞,分为 12 个主要谱系,其中肿瘤细胞和髓系细胞为最丰富类型,髓系细胞进一步聚类为单核细胞、Mo-TAMs 等 5 类,且发现 IDH 野生型胶质母细胞瘤中 Mo-TAM 比例高于 IDH 突变型胶质瘤。作者还剖析人 Mo-TAMs,鉴定出 6 个具有独特分子特征的聚类,如 Hypoxia-TAM 高表达缺氧响应基因,Chemo-TAM 富集趋化相关基因等。通过荟萃分析,作者证实 Mo-TAM 聚类在人和小鼠中保守,但不同类型人弥漫性胶质瘤中 Mo-TAMs 组成有差异,且部分亚群在其他实体瘤中也存在保守性。本图清晰呈现了人弥漫性胶质瘤中 Mo-TAMs 的单细胞景观,揭示其异质性、保守性及分布差异。


(二)图 2:Mo-TAM 分类方案的临床相关性

作者利用癌症基因组图谱(TCGA)- 胶质母细胞瘤 / 低级别胶质瘤 RNA 测序数据集,通过解卷积分析估算各 Mo-TAM 聚类的频率。研究发现,IDH 野生型胶质母细胞瘤中 Hypoxia-TAM、Chemo-TAM、IFN-TAM 和 Lipid-TAM 的频率升高,而 Ribo-TAM 和 Phago/AP-TAM 的频率降低,且不同 Mo-TAM 聚类的比例与胶质瘤分级及关键分子变化相关。尤为重要的是,多因素 Cox 回归分析显示,在胶质母细胞瘤患者中,Hypoxia-TAM 的估算比例可独立预示不良预后,提示其具有肿瘤支持功能。本图通过临床数据集分析,证实了 Mo-TAM 分类方案在评估弥漫性胶质瘤 Mo-TAM 组成方面的可行性、可重复性及临床意义,为通过 Mo-TAM 组成判断患者预后提供依据。


(三)图 3:空间分辨率下 Mo-TAMs 的细胞多样性

作者利用 Ivy - 人胶质母细胞瘤队列,将 Mo-TAMs 的转录特征与人类胶质母细胞瘤组织的不同组织学区域相关联,估算各 Mo-TAM 聚类的比例,发现 Hypoxia-TAM 优先定位于坏死周围区域,其他亚群在不同区域分布有差异。作者重新分析公共空间转录组数据集,发现空间分辨转录组谱再现了不同 Mo-TAM 聚类的预测空间分布。此外,作者绘制人胶质母细胞瘤组织中的缺氧空间梯度,发现随着缺氧梯度增加,Hypoxia-TAM 比例上调,且缺氧水平与肿瘤细胞状态、细胞功能及免疫活性相关。对 Hypoxia-TAM 空间特征的专项分析显示,其转录特征和 ADM 表达在缺氧肿瘤区域显著上调,共染色证实其与坏死区域邻近,且特征基因在胶质母细胞瘤中高表达。本图明确了不同 Mo-TAM 亚群在人类胶质母细胞瘤组织中的空间分布特征,及缺氧梯度与 Mo-TAM 组成等的关联。


(四)图 4:乏氧肿瘤信号促进 Hypoxia-TAM 极化

作者建立体外 Mo-TAM 极化模型,将不同来源的 Mo-TAMs 置于肿瘤细胞条件培养基(TCM)加 1% O₂的培养条件下,发现该条件能有效上调 Hypoxia-TAM 特征基因的表达。作者对巨噬细胞进行 bulk RNA-seq 分析,显示暴露于 TCM 加 1% O₂的巨噬细胞与 Hypoxia-TAM 转录特征相似。通过蛋白质组学和代谢组学分析,作者鉴定出肿瘤细胞衍生的 SPARC 和缺氧诱导的乳酸是诱导 Hypoxia-TAM 特征的关键微环境因子。作者还筛选缺氧相关基因并绘制相互作用网络,发现核心转录因子和缺氧响应基因在 Hypoxia-TAM 中富集。通过基因富集分析和转录因子筛选,作者确定 p50 是 Hypoxia-TAM 特征形成的关键转录因子,且肿瘤细胞产生的 SPARC 和缺氧诱导的乳酸通过激活 p50 促进 Hypoxia-TAM 极化。本图阐明了乏氧肿瘤信号诱导 Hypoxia-TAM 极化的机制及关键调控因子。


(五)图 5:Adm 敲除恢复小鼠胶质母细胞瘤异种移植瘤血管完整性

作者构建 Adm 条件敲除小鼠(Adm cKO mice),通过将 GL261 小鼠胶质母细胞瘤细胞植入小鼠体内建立异种移植模型。作者采用活体成像技术观察肿瘤血管,发现 Adm cKO 小鼠异种移植瘤中肿瘤血管数量和连接点密度适度降低,内皮细胞间间隙显著缩小。免疫染色结果显示,Adm 敲除使内皮黏附连接标志物 VE - 钙黏蛋白表达大幅恢复,而紧密连接标志物、周细胞标志物和血管基底膜标志物表达未受影响。作者通过血管通透性评估发现,Adm cKO 小鼠异种移植瘤中尸胺渗漏区域大幅减少,且 Adm 敲除对小鼠正常脑血管的完整性和通透性无影响。本图证实 Adm 敲除可选择性恢复胶质母细胞瘤异种移植瘤血管的完整性,降低血管渗漏。


(六)图 6:ADM 通过激活 CRLR 信号破坏内皮黏附连接

作者对比 Adm cKO 和野生型小鼠异种移植瘤内皮细胞,发现 Adm cKO 组内皮细胞中黏附连接通路富集且 VE - 钙黏蛋白编码基因 Cdh5 表达增加。用重组人 ADM(rhADM)处理人脑微血管内皮细胞(HBMECs),作者观察到细胞膜上的 VE - 钙黏蛋白转移到细胞质中。当 HBMECs 接受 U937 来源 Hypoxia-TAM 的条件培养基(TAM-CM)处理时,内皮连接明显分离且 VE - 钙黏蛋白内化,而 ADM 拮抗剂(AMA)处理可大幅逆转这些现象,同时减少血管渗漏。通过 CellphoneDB 分析,作者发现 Hypoxia-TAM 与内皮细胞间 ADM-CRLR 相互作用增强,免疫染色证实 CRLR 与内皮细胞标志物 CD31 在人胶质母细胞瘤坏死周围区域共定位且 ADM 信号上调。沉默 CRLR 表达可大幅削弱 ADM 诱导的 VE - 钙黏蛋白内化和血管渗漏,且 ADM 通过激活 CRLR 信号,促进 Src 和 VE - 钙黏蛋白磷酸化,进而导致 VE - 钙黏蛋白内化。本图揭示了 ADM 通过激活 CRLR 信号破坏血管内皮黏附连接的分子机制。


(七)图 7:AMA 处理使人类胶质母细胞瘤异种移植瘤血管正常化

作者在人 GBM-3 异种移植模型中(联合植入 U937 来源 TAMs)使用 AMA 处理,该模型成功模拟了人胶质母细胞瘤缺氧微环境的特征。免疫染色结果显示,AMA 处理恢复了 VE - 钙黏蛋白的表达,维持了内皮连接的完整性,减少了尸胺渗漏,且对小鼠正常脑血管无明显影响。作者进一步检测肿瘤缺氧状态和药物递送情况,发现 AMA 处理使 pimonidazole 标记的缺氧区域大幅减少,阿霉素灌注区域显著增加。磁共振成像结果证实,接受 AMA 处理的 GL261 小鼠胶质母细胞瘤异种移植瘤中血流灌注增加。此外,作者发现 ADM 刺激不影响人 GBM-3 细胞活力,且在未植入 U937 来源 TAMs 的对照模型中,AMA 对 VE - 钙黏蛋白表达和尸胺渗漏影响极小,也不改变缺氧区域和药物灌注区域比例。本图证实 AMA 可通过靶向 TAM 分泌的 ADM,实现人类胶质母细胞瘤异种移植瘤血管的正常化,改善肿瘤微环境和药物递送。


(八)图 8:AMA 改善达拉菲尼递送及治疗效果

作者观察到 BRAF V600E 突变型人胶质母细胞瘤具有明显坏死、VE - 钙黏蛋白缺乏的丰富血管及大量产生 ADM 的 TAMs。在携带 BRAF V600E 突变型人 GBM-4 异种移植瘤的小鼠中,作者设置 vehicle 对照、AMA、达拉菲尼、AMA 联合达拉菲尼四组治疗方案。结果显示,AMA 与达拉菲尼联合治疗显著延长了小鼠生存期,减少了肿瘤负荷。免疫染色和检测表明,AMA 处理提高了 VE - 钙黏蛋白阳性血管的比例,减少了尸胺渗漏,显著增加了肿瘤内达拉菲尼的浓度。此外,联合治疗组中磷酸化 ERK 阳性细胞比例大幅降低,TUNEL 阳性凋亡细胞比例显著增加,表明肿瘤细胞增殖受抑、凋亡增强。本图证实 AMA 可通过改善肿瘤血管功能,提升抗瘤药物达拉菲尼在肿瘤内的递送效率,与达拉菲尼产生协同治疗效果,为胶质母细胞瘤的联合治疗提供实验依据。


作者通过对 51 例弥漫性胶质瘤患者及 12 例小鼠胶质母细胞瘤样本的研究,运用单细胞转录组学、空间转录组学等多组学技术,鉴定出 6 个功能与空间离散的单核细胞来源肿瘤相关巨噬细胞(Mo-TAMs)亚群,重点揭示了乏氧巨噬细胞(Hypoxia-TAM)的特征与作用 —— 其受肿瘤坏死区乏氧微环境诱导,通过分泌肾上腺髓质素(ADM)激活内皮细胞 CRLR 信号,破坏 VE - 钙黏蛋白介导的黏附连接,导致肿瘤血管高通透性;进一步通过基因敲除 ADM 或使用 ADM 拮抗剂(AMA),可恢复肿瘤血管完整性,改善抗瘤药物(如达拉菲尼)的递送效率,延长荷瘤小鼠生存期,且 Hypoxia-TAM 比例或 ADM 高表达与胶质母细胞瘤患者不良预后相关,该研究为胶质母细胞瘤的血管正常化治疗及靶向 Mo-TAM 的精准治疗提供了新的靶点、机制与策略。

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