丽娜是生物学家，曾在军队服役七年，可谓文武双全。她的丈夫是特种兵，常常离家去执行神秘任务。两人虽然彼此相爱，却渐渐疏离。丽娜更忍不住一时寂寞，与同校的教授出轨。丈夫察觉后，绝望地参加了一个敢死考察队，失踪一年，突然回来后却丧失了记忆，更多器官衰竭，濒临死亡。丽娜决定探索丈夫曾去过的神秘区域，寻找救治方法。
那是一方被怪异泡沫笼罩的近海区域，泡沫闪耀着美丽多彩的光泽，被命名为“闪光”。曾有“流星”坠落到海边的灯塔上，周围的生物渐渐异变，人们不得不撤离。泡沫像是有意识的生物，吞噬着一切，又慢慢向外扩展。丽娜参与的五人小队由各领域的专家组成，均是女性，其他人或是患了绝症，或是被生活折磨得毫无生存意志。
五人进入闪光后，无线电等各种通讯设备都失去了作用，更无法持续记忆，只能通过食物的消耗程度判断过了几天，后来她们甚至忘了进食。那里的一切都是无序、混乱的，充满了诡异的美感。一株植物上可以长出形态各异的花朵，同步一致的梅花鹿，鹿角真正生长着鲜活的梅花，鳄鱼的嘴里长着鲨鱼的牙齿，墙上美丽的苔藓似乎会呼吸，人形的植株……队员由此推断，闪光是一种折射，可以将一切甚至基因都折射在各种各样的动植物里，各种本不相融，毫无关联的基因混合成奇特的新生物。她们在废弃的餐厅里发现了一个储存卡，是丽娜丈夫参加的小队留下来的。其中影像更令她们反胃、恶心——这一切都令她们感到未知的恐惧，除了冷静坚定的丽娜，一心求死的心理学家，其他人都濒临崩溃。一个队员被熊掠走，等丽娜找到她，她已经被咬掉了喉咙。那只熊的血盆大口里竟然发出死去队员的求救声，又咬死了第二个队友。第三个队友伤口被感染上植物基因，干脆放弃了抵抗，变成了树人……
丽娜千辛万苦，终于到了一切的起源处——海边的灯塔。里面有一具枯骨、一台摄像机还有一个怪异的洞穴。丽娜在摄像机里看到，丈夫叮嘱相机这端的人回去找她，然后拉开了闪光弹自尽，而后，另一个和丈夫一模一样的男人走进了镜头。
原来那个回来的人，失去记忆，失去情感，只是丈夫的复制人。
丽娜进了那个洞穴。得了绝症的心理学家被分解成一团涌动的光雾，吸收了丽娜眼角的一滴血，重组成了一个人形的怪物。接下来，这怪物不断地模仿着丽娜的动作，最后变成了丽娜的复制人。丽娜急中生智，将丈夫遗留下来的闪光弹放到复制人手中，自己飞快地跑出了灯塔，眼看着灯塔爆炸，闪光终于消失。
独自归来的丽娜和丈夫一样被隔离起来。军方审问她各种细节，谈到闪光的目的时，丽娜说，闪光似乎只是想创造新的事物，在人的角度看来，目的是好是坏也不能定论。那种外星生物只是在寻找一切可供自己制造和复制的生物，乃至对人类产生了威胁。从闪光里走出的丽娜还是丽娜么？她也发生了基因改变，即便在外观上看不出来。复制人丈夫也奇迹般地痊愈，她终于和丈夫团聚了，两人抱在一起，表情木然，眼珠上却有怪异的流动着的光彩。
也许闪光并未被摧毁，它找到了新的生存方式，得以在一对人类配偶身上寄生下去。湮灭意味着毁灭后的重生，丽娜曾刺伤自己，观察血液，就像永生的海拉（该患者已经病逝，但她患癌后被提取的癌细胞至今还在分裂），细胞不断快速地裂变，已被闪光感染了。手臂上的环形蛇纹身似乎也隐喻着这一点。通过自噬，得到新的能量和新的基因排序，重组出非人的人形生物。
