1.awk：
example.txt
awk -F '\t' '{sum[$1]++}END{for(i in sum) print i "\t" sum[i]}' example.txt
result
ref：awk常用命令---统计某一列标签个数 - tianyunzqs的专栏 - CSDN博客
2.sort|uniq
awk '{print $5}' sample1-1.bowtie2.charrna.sam | sort | uniq -c | sort -nk 2
统计MAPQ
