APOBEC3B与PRC2相互作用调节微环境促进肝癌的进展31154396
人:正常组织、肿瘤、癌旁组织(WB、PCR)RT-qPCR and immunoblot assays of A3B mRNA and protein levels in human normal, peripheral and central liver cancer tissues
DEN-induced HCC mouse model 老鼠:正常组织、肿瘤、癌旁组织(WB、PCR)
HBsAg transgenic mice
数据库中高低表达A3B mRNAs 生存曲线分析(有病的、无病的)
处理因素在 HepG2 cells 中表达后的表现 LTα1β2 、 RelA plasmid and RelB plasmid
DNA pull-down assay (特定基因与蛋白结合,从而检测基因的功能) DNA pull down-MS是体外研究DNA与蛋白互作的有力工具。该技术将生物素标记的DNA片段结合在链霉亲和素磁珠上,再与细胞核蛋白孵育,纯化出与DNA片段互作的蛋白,洗涤洗脱得到的蛋白产物,做western-blot检测特定蛋白是否与靶DNA片段结合;做质谱鉴定即可筛选出与DNA片段可能互作的蛋白信息(如具体某个或某些转录因子/组蛋白等)
荧光素酶报告检测
在其他细胞中再次验证实验结果
TCGA-HCC肿瘤中NFKB2、RELB和A3B的相关性用Pearson相关系数表示
流式细胞仪检测某种细胞的数量
猜想可能跟某种因子有关,并在WB、PCR中定量,然后统计分析有无意义。
找到想研究的蛋白,看看有没有它的下游蛋白,有3个,均出现了,看他们的结合方式,用免疫荧光染色,下边的看不懂了 ,太难了!