linux app store-bioconda
一、找到清华镜像 谷歌搜索： miniconda 清华
二、找到miniconda适配下载地址
1.查看服务器位数 uname -a
Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
2.wget 加复制链接 下载Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh脚本
3.bash 安装Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh 注意名字对应（可用ls确认下脚本名）否则会报找不到文件 yes/ENTER
4.激活conda source ~/.bashrc
5.添加镜像：
# 使用中科大的镜像
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes
三、运行conda
1.conda list
2.安装软件 conda install fastqc -y （-y是yes，安装过程中conda问你的问题全部回答yes）默认安装最新版本，但是有的软件新版本bug比较多，可能需要用到老版本，如果要指定版本号，可以conda install fastqc=0.11.7 -y
3.确认fastqc软件是否安装成功，输入fastqc --help
4.卸载软件 conda remove fastqc -y
四、选修部分
1.查看当前conda有哪些环境
conda info --envs (前面带*的就是默认的)
2.建立一个名叫rnaseq的conda环境，然后指定python版本是3，安装软件fastqc、trimmomatic
conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y
3.创建完之后，再次查看一下我们的conda环境，conda info --envs
4.激活新的conda环境，conda activate rna-seq
5.退出当前环境，运行conda deactivate
学习心得
多ls查看下目录名 多反思总结
conda安装下载
