首先，不是所有的数据都一定能再发，比如别人就用了这个数据集（都是一个数据集，重复的可能性很大）分析了一个结果，你还拿这个数据集分析了类似甚至一样的结果，那就没意义了，算是“盗版/抄袭”了。

1）别人用A数据集分析的差异基因，你可以再结合，限制个范围，筛选出另外专题的差异基因（要知道一个数据集里面的基因非常多，但具体分析哪些基因，需要你课题好好设计）

2）按分析目的（分组可以非常自由，全看你课题设计是否灵活多变）：

1.疾病vs正常，样本分组，得到差异基因

2.依据某基因高低表达，进行样本分组

3.风险risk计算，按中值进行高低风险组分组，两组进行各种比较，如KM分析

4.根据免疫评分分组，

而病人的sample，信息比较多，这些信息如果你的课题用得到（根据信息来分组，非常自由！），完全可以利用起来进行自由分组。

比如：

A病人，是51，复发乳腺癌，

B病人，37，原发乳腺癌

C病人，52，原发乳腺癌

你可以按年龄进行分组，那么＞50和＜50，就是A+C的组 vs B组

按原发 vs 复发，那么A vs B+C组

（所以很多初学者也问这样的问题：老师，GSE数据集很多样本我用不上，不在我的分组里面，怎么办？——那就不用，选择你需要的分组进行分析就可以）

样本是可以根据你分析的目的进行分组的，这个一定要自由，这个也再次回答了有同学问，数据别人分析了，自己是否还能分析？

相信你的课题设计的思路更加灵活自由了~加油！！！