推荐一本生物信息学相关在线电子书

我是在找snakemake参考资料的时候找到的这本在线电子书,链接是

https://eriqande.github.io/eca-bioinf-handbook/

image.png

查了下作者的信息,这个是作者的主页

https://eriqande.netlify.app/

image.png

全书总共29个章节,但是其中某些章节还没有写完

image.png
image.png

前面14个章节介绍了

  • linux操作系统的一些知识
  • shell编程
  • sed awk 命令
  • 正则表达式
  • 计算集群
  • Rstudio
  • markdown
  • snakemake

后面的章节主要介绍了一些生物信息学的内容

  • 文件格式
  • 基因组组装(我看了这一章没有写完)
  • 变异检测
  • 操作vcf文件
  • 扩增子测序
  • 27章是从原始测序数据到最终变异结果的一个完整流程,提供数据代码,不过代码的写法涉及到计算集群的使用,好像还涉及到snakemake
  • 最后介绍到了群体基因组学

我是重点看了snakemake 那一章节,写的还挺详细的。

如果你正在学习生物信息学,可以找这本书来参考参考

欢迎大家关注我的公众号

小明的数据分析笔记本

小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享:1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子;2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记;3、生物信息学入门学习资料及自己的学习笔记!

©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
平台声明:文章内容(如有图片或视频亦包括在内)由作者上传并发布,文章内容仅代表作者本人观点,简书系信息发布平台,仅提供信息存储服务。

推荐阅读更多精彩内容