我是在找snakemake参考资料的时候找到的这本在线电子书，链接是
https://eriqande.github.io/eca-bioinf-handbook/
image.png
查了下作者的信息，这个是作者的主页
image.png
全书总共29个章节，但是其中某些章节还没有写完
image.png
image.png
前面14个章节介绍了
- linux操作系统的一些知识
- shell编程
- sed awk 命令
- 正则表达式
- 计算集群
- Rstudio
- markdown
- snakemake
后面的章节主要介绍了一些生物信息学的内容
- 文件格式
- 基因组组装（我看了这一章没有写完）
- 变异检测
- 操作vcf文件
- 扩增子测序
- 27章是从原始测序数据到最终变异结果的一个完整流程，提供数据代码，不过代码的写法涉及到计算集群的使用，好像还涉及到snakemake
- 最后介绍到了群体基因组学
我是重点看了snakemake 那一章节，写的还挺详细的。
如果你正在学习生物信息学，可以找这本书来参考参考
欢迎大家关注我的公众号
小明的数据分析笔记本
小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享：1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子；2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记；3、生物信息学入门学习资料及自己的学习笔记！
