内容复习--空间共定位效果图

作者,Evil Genius

新年第一天,我们来复习一下绘图

空间的分析项目也越来越多了,常见的两种细胞类型的共定位图、或者配受体的共定位图,也成了常见的可视化展示方法




关于这个分析,在之前的文章也详细分析过,文章在10X空间转录组时空基因细胞动态(共定位)绘图

包括23的培训视频也教学过,视频在空转第18课共定位绘图,很多人都买了盗版(盗版人员记得替我挡挡灾啊),应该也看到这部分内容了。

借助Seurat的力量很容易实现这部分内容,不过之前都是基础Seurat V4,今天我们更新一下V5的部分,也包括HD数据实现这部分内容。


主要借助的函数

FeaturePlot(pbmc3k.final, features = c("MS4A1", "CD79A"), blend = TRUE)

我们稍作改动,借助Seurat V5实现空间配受体共定位和两种细胞类型的共定位

做好基础分析,到umap

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