conda安装
- 进入biosoft目录
cd ~/biosoft - 下载miniconda
谷歌搜索“miniconda 清华”(是清华的conda镜像网站,
https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/)
uname -a(查看服务器是多少位)按需下载
wget 下载链接(下载)
3.安装
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
- 激活conda
source ~/.bashrc - 添加镜像
使用清华镜像
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes
使用conda
- conda list 查看当前所有软件列表
- conda search fastqc 搜索软件
- conda install fastqc -y (加上-y是自动安装)
- conda remove fastqc -y 卸载软件