学习小组Day6笔记--yuting

Day6-学习R包

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1、安装和加载R包

1.1镜像设置

1.1.1初级模式:用options()$repos检验

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1.1.2升级模式:用options()$BioC_mirror检验
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1.1.3高级模式:R的配置文件 .Rprofile
Rstudio最重要的两个配置文件:
(1)在刚开始运行Rstudio的时候,程序会查看许多配置内容,其中一个就是.Renviron,它是为了设置R的环境变量;
(2).Rprofile就是一个代码文件,如果启动时找到这个文件,那么就替我们先运行一遍(这个过程就是在启动Rstudio时完成的)
file.edit()编辑文件

1.2安装R包

R包安装命令是install.packages(“包名”)#BiocManager::install(“包名”)


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1.3加载包

library(包)

require(包)
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2、dplyr五个基础函数

2.1.mutate(),新增列
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2.2.select(),按列筛选

(1)按列号筛选


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(2)按列名筛选
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2.3.filter()筛选行

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2.4.arrange(),按某1列或某几列对整个表格进行排序
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2.5.summarise():汇总

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3、dplyr两个实用技能

3.1、管道操作 %>% (cmd/ctr + shift + M)

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3.2、count统计某列的unique值
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4、dplyr处理关系数据

即将2个表进行连接,注意:不要引入factor
stringsAsFactors=FALSE就是不变成属性数据,按字符串读入
data.frame()函数创建数据框,紧密耦合的变量集合,这些变量共享了矩阵和列表的许多属性,它们被大多数R的建模软件用作基本的数据结构。

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4.1.內连inner_join,取交集

取x的交集数据
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4.2、左连left_join

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4.3、全连full_join

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4.4.半连接:返回能够与y表匹配的x表所有记录semi_join
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4.5.反连接:返回无法与y表匹配的x表的所记录anti_join
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4.6、简单合并

在相当于base包里的cbind()函数和rbind()函数;注意,bind_rows()函数需要两个表格列数相同,而bind_cols()函数则需要两个数据框有相同的行数
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