参考 生信星球 公众号教程
（1）准备工作
（2）开始使用conda
（1）准备工作
1.压缩软件 bzip2
一个压缩软件（或者说命令），一般服务器都有，阿里云免费版未自带
装了没？
输入bzip2，检查有没有这个软件，有的话会显示
我们这里not fund 果真没装
操作界面
现在就装
yum install -y bzip2
一顿命令猛如虎 就好了
操作界面
2. 软件管理Miniconda
手机“应用商店”的存在， 软件一键安装
日常生信使用小而精的【Miniconda】即可
参考 生信星球 公众号文章图
现在就装
- 登陆服务器，进入biosoft目录
cd biosoft # biosoft是前面我们建好，专放软件的目录
- wget 命令 下载安装脚本
wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
sh是脚本（就是一个程序，后台的代码）文件的后缀，也就是说其实这是一个下载的脚本，如果你安装失败了，这个脚本是不需要重新下载的，还是可以用的 —— 生信星球 公众号
操作界面
- 怎么安装miniconda
（如果安装失败，只需要从这里 重新开始）
用bash运行这个安装用的脚本
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
输入代码回车
一路敲 enter，或 yes ，敲到linux感谢你
操作界面
切记： 要激活
source ~/.bashrc # 输入激活
再输入 conda， 出现满屏幕信息 就是安装成功啦。
操作界面
添加镜像
我的理解是 国外出品，下载源 设置链接是清华的，保证速度
Windows系统：复制粘贴不是ctrl+c和ctrl+V，是鼠标左键和右键
下面代码一行一行 在linux运行
# 使用清华镜像
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes
操作界面
准备工作正式结束！
（2）开始使用conda
- 查看当前所有软件列表
conda list
操作界面部分截图
- 搜索软件
搜一下数据质控软件 fastqc
conda search fastqc
结果是fastqc不同版本展示
操作界面
- 安装软件
加上-y是自动安装
conda install fastqc -y
默认安装最新版本，
万一新版像window10 bug多
就要指定安装老版本
比如：指定版本号
conda install fastqc=0.11.7 -y
- 卸载软件
conda remove fastqc -y
操作界面
谢谢您的观看！
