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【求助】请问引物序列中的Y,K,W,M,R等代表什么意思？谢谢！
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lzl2010楼主
发布于 2012-06-28
只看楼主
这个帖子发布于 8 年零 212 天前，其中的信息可能已发生改变或有所发展。
我要准备做细菌的MLST，在网站（http://pubmlst.org/）上查到细菌的管家基因的引物，其中有几条是这样的，引物序列中有Y,K,W,M,R，还有一条是把有的碱基用括弧括起来了，请问代表是什么意思啊？望各位前辈不吝赐教，指点迷津，谢谢！
fusA:F:fusA7 ATCGGTATTTCTGCKCACATYGAT
fusA:R:fusA8 CCAACATACKYTGWACACCTTTGTT
pyrG:F:pyrG7 GGTGTTGTTTCATCACTAGGWAAAGG
pyrG:R:pyrG8 ATAAATGGTAAAGAYTCGATRTCACCMA
rpoB:F:Vic4 GGCGAAATGGC(AGT)GA(AG)AACCA
rpoB:R:Vic6 GA(AG)TC(CT)TCGAAGTTGTAACC
最后编辑于 2012-06-28
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全部讨论（4）
发布于 2018-10-21
简并碱基：
W=A or T
S=C or G
R=A or G
Y=C or T
K=G or T
M=A or C
B=C, G or T
D=A, G or T
H=A, C or T
V=A, C or G
N=A, C, G, or T
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发布于 2012-06-28
兼并碱基 自己可以去查
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发布于 2019-08-07
简并碱基符号对应表
简并碱基
正常碱基
R A/G
Y C/T
M A/C
K G/T
S
G/C
W A/T
H A/T/C
B G/T/C
V G/A/C
D G/A/T
N A/T/C/G
