宋政和六年（1116），宝光寺更名为大通慈应禅院，俗称大通寺。明万历六年（1578），广东大旱，禾稼枯死，民众把达岸禅师的肉身从大通寺请出，用船载过白鹅潭，抬到光孝寺举行祈雨仪式。不料仪式还没完毕，已经风起云涌，下起了倾盆大雨，水深三尺，田里的禾稼全回黄转绿了，众民欢声大悦。康熙朝的《南海县志》亦有记载：“大通寺在大通堡，有达岸禅师肉身求雨辄应。”
祈雨仪式结束后，人们打算把达岸禅师的肉身抬回大通寺，但怎么也抬不起来，就像生了根一样。后来有人用杯珓卜算，结果说达岸想留在光孝寺，于是人们便在光孝寺为禅师辟了一间龛室。当达岸禅师的肉身进入龛室时，芳村竟传来惊人的消息，说大通寺失火，全寺烧塌了。人们这才恍然大悟，原来禅师已预知大通寺会失火，所以留在光孝寺避过一劫。
烧毁的大通寺一直荒废着，寺中有一口龙霞井，每逢风雨前夕，便有烟霞缭绕升腾，又称“烟雨井”。清同治朝的《番禺县志》载：“烟雨井在大通寺中，晨熹初散，常袅轻烟，所谓大通烟雨是也。”
