RNA m5C甲基化位点预测工具

前面小编给大家介绍了一个新的研究热点,RNA m5C甲基化。

【科研热点】RNA m5C甲基化

RNA m5C甲基化相关基因列表

今天小编就给大家介绍几个预测RNA m5c甲基化的工具。


上面这张表格里面了列出了目前主流的一些预测RNA m5C甲基化的工具。从方法分类上看,主要可以分成两类。第一列是基于SVM(support vector machine,支持向量机)的方法,第二种是基于RF(random forest, 随机森林)的方法。这两大类方法都属于ML(machine learning,机器学习)的范畴。

这张表格出自于下面这篇SCI文章,也是一篇讲m5C位点预测的方法的文章。发表于2021年10月,算是一篇比较新的文章。一般这种方法学的文章,都会跟前面已经发表的工具进行比较,在同样的数据集上,表现要优于,至少不能差于已经发表的工具,才能顺利发表。


上面展示的工具中,有些是提供网页版工具的。从表格的第二列

Webserver/software availability我们就能看出来。如果为yes,证明是提供对应的网页工具或者本地版下载。

  1. iRNA-m5C1
    http://lin-group.cn/server/iRNA-m5C/service.html

2. RNAm5Cfinder1
http://www.rnanut.net/rnam5cfinder/

3. iRNAm5C-PseDNC

http://www.jci-bioinfo.cn/iRNAm5C-PseDNC

遗憾是的是目前这个工具对应的网页已经打不开了。其实很多网络工具都逃不过这个宿命。因为上线一个网络工具,是需要有服务器的,对于一些计算密集型的工具,对计算资源的要求还是很高的,这些都需要不菲的经费来支持。可能文章刚发表的几个月还能访问,时间久了机器就down掉了,所以大家还是且用且珍惜吧!

RNA m5C甲基化位点预测工具

©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 216,324评论 6 498
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 92,356评论 3 392
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 162,328评论 0 353
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 58,147评论 1 292
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 67,160评论 6 388
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 51,115评论 1 296
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 40,025评论 3 417
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 38,867评论 0 274
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 45,307评论 1 310
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 37,528评论 2 332
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 39,688评论 1 348
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 35,409评论 5 343
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 41,001评论 3 325
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 31,657评论 0 22
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 32,811评论 1 268
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 47,685评论 2 368
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 44,573评论 2 353

推荐阅读更多精彩内容