细胞死亡与肿瘤免疫-学习笔记

关于坏死性凋亡、铁死亡和细胞焦亡在抗癌免疫中的作用的生物信息学证据的总结,我们回顾了肿瘤免疫功能障碍和排斥(TID)(http://tide.dfci.harvard.edu/query/)和肿瘤免疫估计资源(TIMER)(https://cistrome.shinyapps.io/timer/)数据库)中发表的数据。总体而言,细胞死亡和T细胞功能障碍的关键标志之间的关系取决于肿瘤类型(图4a)。

图4 基于分子特征的坏死性凋亡、铁死亡和细胞焦亡对T细胞功能障碍和CD8+T细胞浸润的影响的生物信息学证据。a.根据四组37个独立队列(核心队列、免疫治疗数据集、CRISPR筛选数据集和免疫抑制细胞类型数据集)的分子特征,评估了坏死性凋亡、铁死亡和细胞焦亡对T细胞功能障碍和CD8+T细胞浸润的影响)。核心队列由使用基因表达数据获得的五个最可信的结果组成,高 z 分数(红色)表明指定的基因促进了T细胞功能障碍。免疫治疗数据集由 12 个接受ICI或ACT的患者数据集组成。在这个集中,一个高z分数(红色)代表指定基因在改善免疫治疗效果方面的不利作用。小鼠癌细胞的CRISPR筛选确定了基于17个队列的基因,这些基因的敲除增强了T细胞介导的肿瘤细胞杀伤功效;在这些研究中,z值<0(蓝色)反映了在T细胞功能或免疫治疗效果增加后指定基因的下调。免疫抑制细胞限制T细胞的肿瘤浸润,包括癌症相关成纤维细胞(CAF)、髓源性抑制细胞(MDSC)和肿瘤相关巨噬细胞(TAM)的M2亚型,高z分数(红色)表示特定基因在免疫抑制细胞中过度表达。B.评估T细胞功能障碍的一个例子。大量CTL浸润仅在来自SLC7A11低表达患者的肿瘤样本中预测生存期延长,表明SLC7A11可能促进T细胞功能障碍。c.显示了基于分子特征的坏死性凋亡、铁死亡和细胞焦亡对CD8+T细胞浸润的影响。

例如,在子宫内膜癌队列中,只有在SLC7A11表达较低的患者中,细胞毒性T淋巴细胞(CTL)比例越高,总生存期越长,说明抗癌免疫增强与铁死亡敏感性增加的结果平行(图4b)。因此,ICIs和铁死亡诱导剂的组合可能会延长子宫内膜癌患者的生存率。然而,这种关系在其他核心队列中不存在。RIPK1、RIPK3和MLKL这三个启动坏死性凋亡的分子在两个以上的核心队列中与明显的T细胞功能障碍有关;然而,在许多ICIs的临床研究中,它们的过度表达预示着延长生存期,这表明ICIs挽救了坏死性凋亡标志物在T细胞功能中的不利作用。此外,我们还计算了CD8+T细胞浸润与不同类型细胞死亡的基本标志物表达之间的相关性(图4c)。然后,我们比较了七种常见癌症的这些相关性,发现促坏死性凋亡、促焦亡和促铁死亡特征广泛地与CD8+T细胞浸润有关。相反,抗铁死亡的特征与CD8+T细胞浸润相关较少。因为CD8+T细胞的大量富集通常反映出更好的ICIs疗效,ICIs和诱导细胞死亡的药物的合理组合可能是有效的抗癌方式。

结论

在大多数癌症类型的患者中,应用ICI受到以下事实的显着限制:只有三分之一的患者有反应。综上所述,基于现有的实验室和生物信息学证据,我们揭示了抗癌免疫和非凋亡细胞死亡机制之间的广泛联系。在此背景下,伴随诱导非凋亡性肿瘤细胞死亡是治疗癌症的一种很有前途的策略。一个长期存在的挑战是设计有效的药物,通过严格的安全性测试,专门激活上述人类非凋亡细胞死亡。然而,在不久的将来,医疗机构被鼓励进行临床试验,使用经批准的药物治疗患者,这些药物可以激活铁死亡、细胞焦亡或坏死细胞凋亡,同时使用ICIs。虽然这些药物可能不是途径特异性的,但这些药物组合的有效性、安全性和副作用可能为未来的研究提供有价值的建议。

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