合理性：肠道菌群的组成改变与心血管疾病（CVD）相关，但是它们与宿主的代谢和免疫的功能相关性与CVD的发生是否相关仍不清楚。
目标：在存档完好的队列中综合评估微生物组、血清代谢组、心脏代谢表型和CVD风险之间的关联，并且发现饮食-微生物-代谢-免疫的交互作用。
方法和结果：我们在Lifelines DEEP队列和另外一个临床肥胖队列中评估231中血清代谢物与基于宏基因组的微生物种和通路之间的关联。校正了年龄、性别和BMI后，肠道微生物组在基于人群和肥胖两个队列中分别能解释 ≤11.1%和16.4%的血清代谢物变化。在VLDL、IDL、和LDL的脂蛋白亚类中发现了肥胖特有的微生物与脂类成分之间的关联。在肥胖个体中，微生物 L-methionine的生物合成和 Ruminococcus种与心血管表型（即分别为动脉粥样硬化和肝脂肪含量）相关。在人群队列中，通过微生物-饮食-炎症综合分析与CVD的代谢风险得分的关联分析，发现了48个微生物通路与CVD风险相关，并且独立于饮食和炎症。我们数据还显示血清而不是粪便的断链脂肪酸水平与炎症和CVD风险相关。
结论：本研究在基于人群的和临床肥胖两个队列中，展示了最大的基于宏基因组的血清代谢组和微生物与饮食、炎症、CVD风险和心脏代谢表型的关联分析。我们的研究发现了新的与特定脂蛋白亚类相关的微生物种和通路，揭示了肠道微生物组与宿主健康之间的功能相关，这些为疾病预防和治疗发展微生物靶向疗法提供了依据。
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