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  • 常用软件记录

    作为一名科研人员,研究方向集合了流行病学、生物统计学和生物信息学,算是半个程序员,断断续续也积累了一些经常用的软件,非常有助于提高自己的工作效率...

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    微生物组数据的centered log-ratio transformation

     在分析肠道微生物数据中,一般会对数据进行一定的转换,以使数据尽可能的服从正态分布。常用的方法有Centered Log-ratio (CLR)...

  • Depletion of microbiome-derived molecules in the host using Clostridium genetics

    摘要肠道微生物能够产生上百种的小分子,这些小分子在宿主循环中有较高的浓度。揭示每个小分子对宿主生物的贡献仍然存在难题。我们开发了一个在Clost...

  • Gut Microbial Associations to Plasma Metabolites Linked to Cardiovascular Phenotypes and Risk

    合理性:肠道菌群的组成改变与心血管疾病(CVD)相关,但是它们与宿主的代谢和免疫的功能相关性与CVD的发生是否相关仍不清楚。目标:在存档完好的队...

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    Polygenic Risk for Depression Increases Risk of Ischemic Stroke: From the Stroke Genetics Network...

    背景和目的:尽管在大型前瞻性研究中抑郁是卒中的一个风险因素,但是这两者之间是否有共同的遗传基础尚未知。 方法:我们将从精神病基因组研究联盟(Ps...

  • Discordant transmission of bacteria and viruses from mothers to babies at birth.

    背景:人类肠道早起的微生物定植会对宿主的整个生命周期产生影响。新生儿肠道细菌微生物组和病毒组的早期构成如何还未知。为了更好的理解母亲的肠道微生物...

  • Plasma protein patterns as comprehensive indicators of health.

    蛋白质是介导基因功能,调节疾病、行为和药物治疗的效应分子。它们为个性化、系统化和数据驱动的诊断、预防、检测和治疗展示了大量的潜在资源。但是,利用...

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    Impact of chronic dietary red meat, white meat, or non-meat protein on trimethylamine N-oxide met...

    在健康男性和女性中长期食用红肉、白肉和非肉类蛋白对氧化三甲胺(TMAO)的影响 目标:肉碱(carnitine)和胆碱(choline)是肠道菌...

  • Gut Microbiome Fermentation Determines the Efficacy of Exercise for Diabetes Prevention.

    运动对于糖尿病的管理是一种非常有效的方法,但是因为运动抵抗现象(例如,代谢健康对运动的反应缺乏或者不良反应)这种方法受到了限制。这里,在39个未...