差异分析,老生常谈的问题,代码网上一搜都是一堆,但是真正难的地方在于如何准备数据集,我要怎么做,才是最优解呢?

https://www.ezygene.com/tool/differential_analysis_visualization
内嵌数据库,可自由选择合适的数据集,当然也支持自己上传表达矩阵
在分析的时候需要注意的是分组文件如何获取

转录组数据预处理-导出样本信息
将该样本的信息导出,自己设置分组即可

如这里选择GSE31210的数据集,先获取样本信息,在设置分组

整理成如下的格式

这里的分组我写的A和B



提交后,等待运行成功就可以了
简单的爆炸,当然,你也可以使用上传数据的形式进行,只需要自己准备一个表达谱矩阵即可,分组文件一样的设置。

接下来就是差异分析的可视化了,直接选择第二步


火山图,参数可以按照需求自己更改


logfc排序散点图

根据差异分析的结果制作一个基因分组的表格


差异基因表达的热图

差异基因表达的热图

随机选的数据,图不是很好看




