最新15分生信,单细胞揭示骨髓病变中的衰老景观诱导骨关节炎软骨损伤!实验只有一点点,分析也常见,其对结果的解释值得学习!

单细胞测序揭示骨髓病变中的衰老免疫景观诱导骨关节炎软骨损伤

文章信息

  • 发表杂志 Bone Research
  • 中文标题 单细胞测序揭示骨髓病变中的衰老免疫景观诱导骨关节炎软骨损伤
  • 英文标题 Single-cell sequencing reveals a senescent immune landscape in bone marrow lesions inducing articular cartilage damage in osteoarthritis
  • 影响因子 ~15
  • 发表日期 2025年11月21日
  • DOI 10.1038/s41413-025-00467-4

小编有话说:很多客户会问,这个分析有什么意义?本篇文章的分析,例如细胞通讯,都是常见的结果和图,重点是在于结合疾病背景对结果的解释!那些显著的通路自然有他的意义。这也是写文章讨论的关键!同一个分析不同的人写,可能会大幅影响文章的影响因子。

研究概述

骨关节炎(OA)是一种年龄相关的退行性疾病,影响膝关节的所有组织。骨髓病变(BML)是OA的早期标志,与软骨损伤恶化密切相关。本研究通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析了来自4名接受单髁膝关节置换术患者的骨髓样本(非BML和BML区域)以及关节软骨样本(完整和受损区域),系统探索了BML的免疫景观和BML-软骨相互作用机制。

核心发现

  1. 非经典单核细胞(Non-classical monocytes)表现出高炎症、高OA基因特征和高衰老评分,是促进OA进展的关键细胞群
  2. 受损软骨中前纤维软骨细胞(PreFC)显著耗竭
  3. 非经典单核细胞通过TNF信号通路与软骨细胞(特别是PreFC)相互作用,诱导软骨损伤
  4. TCF7L2被鉴定为单核细胞和软骨细胞衰老的共同转录调控因子,促进衰老相关分泌表型(SASP)的发展

Figure 1:BML中的免疫细胞景观分析

研究目标

探索BML区域骨髓(BM)的免疫细胞组成****和炎症特征,揭示BML如何促进OA进展。

方法与目的

分析类型 具体方法 目的
单细胞测序 对4例患者的非BML和BML区域BM进行scRNA-seq(共43,432个细胞) 识别细胞亚群并比较两组差异
细胞注释 使用CellTypist自动注释+文献验证 鉴定24种细胞亚群(包括6种髓系细胞、8种T细胞、4种B细胞等)
功能评分 炎症基因集和OA基因集评分 评估各细胞群的促炎和促OA能力

实验设计与结果

为什么进行BML与非BML的比较? BML是OA早期标志,MRI显示为亚软骨骨高信号区域,与软骨体积减少密切相关。通过比较BML和非BML区域,可以揭示病变组织的特异性免疫改变。

关键发现

  1. 细胞组成变化(Fig. 1a-c):
  • BML组中经典单核细胞比例下降
  • 非经典单核细胞、CD16+ NK细胞、Tcm/Naive helper T细胞比例上升(虽无统计学差异,但趋势明显)
  1. 炎症和OA评分(Fig. 1d-e):
  • 巨噬细胞、非经典单核细胞、经典单核细胞具有最高的炎症评分和OA评分
  • BML组的单核细胞炎症评分和OA评分显著高于非BML组
  1. 生物学通路富集
  • BML中经典单核细胞上调IL-17信号通路、TNF信号通路、细胞衰老通路
  • 非经典单核细胞同样上调炎症通路
  1. 细胞间通讯(Fig. S5a):
  • 经典单核细胞是BM中主要的信号接收者和发送者
  • 主要信号包括ANNEXIN、MIF、GALECTIN、CCL等免疫相关信号

逻辑解读

→ BML中单核细胞向促炎状态转变 → 非经典单核细胞表现出最高的炎症和OA特征 → 这些细胞可能是BML促进OA进展的关键驱动因素

Figure 2:软骨细胞的单细胞景观分析

研究目标

解析完整软骨受损软骨的细胞组成变化,识别与OA进展相关的关键软骨细胞亚群。

方法与目的

分析类型 具体方法 目的
单细胞测序 对4例患者的完整和受损软骨进行scRNA-seq(共54,412个细胞) 识别软骨细胞亚群
细胞鉴定 基于文献标记基因注释16个细胞群 区分不同功能状态的软骨细胞
拟时序分析 Monocle2和RNA velocity分析 揭示细胞分化轨迹
免疫组化验证 IHC检测PreFC、FC-2、OssifyC标记蛋白 验证细胞亚群比例变化

实验设计与结果

为什么重点关注PreFC? 最近研究发现PreFC以THBS1和PIEZO2为标记,能够预防软骨退化,OA患者PreFC减少与软骨损伤加重相关。

关键发现

  1. 细胞组成变化(Fig. 2a-c):
  • PreFC在受损软骨中显著减少(*P < 0.05)
  • FC-1、pre-HTC、PathC、OssifyC、内皮细胞、巨噬细胞比例上升
  1. PreFC的功能特征(Fig. 2d):
  • 高表达THBS1、PIEZO2(PreFC标记基因)
  • 参与细胞外基质组织、软骨发育、软骨细胞分化等维持软骨稳态的生物学过程
  • 同时参与OA相关过程(血管生成、骨化、机械刺激检测)
  1. 分化轨迹分析(Fig. 2e-f):
  • Monocle分析显示:PreFC沿轨迹分布,OssifyC位于终点
  • RNA velocity分析揭示:PreFC可分化为FC-1、FC-2、PathC
  • 这解释了为什么受损软骨中PreFC减少而FC增加
  1. 免疫组化验证(Fig. S9):
  • 完整软骨的表层区(SZ)和中层区(MZ)中THBS1+和PIEZO2+细胞(PreFC)显著多于受损软骨
  • 受损软骨中Lubricin+细胞(FC-2)在SZ显著增多
  • OPN+细胞(OssifyC)在受损软骨的SZ和MZ显著增多
  1. 细胞间通讯(Fig. S5b):
  • PreFC是软骨内部信号接收和发送的核心
  • 发送信号:ANGPTL、MIF、FGF、GRN、PDGF、BMP(促进软骨修复和稳态)
  • 接收信号:VISFATIN、TGFb、MK、BMP、GRN

逻辑解读

→ PreFC维持软骨稳态 → OA进程中PreFC向FC-1/FC-2/PathC分化 → PreFC耗竭导致软骨保护功能丧失 → 受损软骨中病理性软骨细胞(FC、PathC、OssifyC)增多


Figure 3:BML与软骨之间的细胞通讯网络

研究目标

揭示BML如何通过细胞间信号传递影响软骨损伤,识别关键的通讯路径。

方法与目的

分析类型 具体方法 目的
CCI分析 使用CellChat分析BM-软骨间的配体-受体相互作用 识别关键信号通路
信号强度评估 计算21条BM→软骨信号和25条软骨→BM信号 量化信号传递强度
关键通路验证 重点分析TNF、VISFATIN、CSF、SEMA3等信号 揭示BML诱导软骨损伤的机制

实验设计与结果

为什么分析BM-软骨通讯? 证据表明软骨和软骨下骨之间存在直接的分子通讯,血管通道连接骨髓、关节腔和滑膜,促进信号和细胞浸润。因此BML微环境改变可能通过这种通讯导致软骨退化。

关键发现

  1. BM→软骨信号(Fig. 3a):
  • 高强度信号:MIF(促炎)、GALECTIN(软骨稳态)、VISFATIN(软骨降解)、TGFb(软骨稳态)
  • PreFC是主要的信号接收者,接收VISFATIN、TGFb、MK、BMP、GRN信号
  1. 软骨→BM信号(Fig. 3b):
  • 高强度信号:MIF、ANNEXIN、ANGPTL(促炎)、CXCL、CCL(募集单核细胞)
  • 经典单核细胞是主要的信号接收者和发送者
  1. TNF信号通路(Fig. 3d):
  • 非经典单核细胞是唯一向软骨细胞发送TNF信号的细胞群
  • PreFC和EC是TNF信号的主要接收者
  • TNF-TNFRSF1A配体-受体对介导此通讯
  1. VISFATIN信号(Fig. 3c):
  • 经典单核细胞通过NAMPT-(ITGA5+ITGB1)向FC-2、PathC、EC等发送VISFATIN信号
  • VISFATIN促进软骨基质降解
  1. 骨重塑相关信号(Fig. 3e-f):
  • PreFC向非经典单核细胞发送SEMA3信号(抑制破骨细胞分化)
  • FC-2向非经典单核细胞发送CSF信号(促进破骨细胞形成)
  • 提示非经典单核细胞可能是软骨下骨破骨细胞形成的主要细胞群

逻辑解读

→ BML中的非经典单核细胞发送TNF信号 → PreFC接收TNF信号后向FC-2/PathC分化 → PreFC耗竭,软骨保护功能丧失 → FC-2反过来促进非经典单核细胞的破骨细胞分化 → 形成BML-软骨损伤的恶性循环


Figure 4:衰老评估与转录因子TCF7L2的鉴定

研究目标

评估BML和受损软骨的衰老水平,识别调控衰老的关键转录因子

方法与目的

分析类型 具体方法 目的
衰老评分 使用SenMayo基因集进行GSVA评分 量化各样本和细胞群的衰老程度
转录调控网络 pySCENIC分析识别regulons 鉴定细胞特异性转录因子
TCF7L2靶基因预测 整合5个数据库预测TCF7L2靶基因 揭示TCF7L2调控的信号通路

实验设计与结果

为什么关注衰老? 衰老细胞通过分泌SASP(衰老相关分泌表型)影响周围细胞,导致炎症和组织退化。非经典单核细胞的促炎CCIs类似SASP表型,提示衰老在OA中的关键作用。

关键发现

  1. 样本水平衰老评分(Fig. 4a-b):
  • BML组骨髓受损软骨的衰老评分显著高于对照组(****P < 0.0001)
  1. 细胞水平衰老评分(Fig. 4c-d):
  • BM中:非经典单核细胞和经典单核细胞具有高衰老评分
  • 非经典单核细胞的衰老水平显著高于经典单核细胞
  • 软骨中:FC-2具有最高衰老评分,高于PreFC
  • 免疫荧光验证:非经典单核细胞(CX3CR1+)的p21水平高于经典单核细胞(CCR2a+);FC-2(Lubricin+)的p21水平高于PreFC(THBS1+)
  1. 转录因子分析(Fig. 4e-f):
  • pySCENIC识别出5个非经典单核细胞特异性转录因子:TCF7L2、PLAGL2、MEF2A、ZBTB7A、POU2F2
  • 其中TCF7L2、MEF2A、ZBTB7A在软骨细胞中也有调控作用
  • TCF7L2在PreFC和FC-2中具有高AUCell评分
  • 由于FC-2衰老水平高于PreFC,且PreFC可分化为FC-2,推测TCF7L2促进单核细胞和软骨细胞衰老
  1. TCF7L2靶基因和通路(Fig. 4g-h):
  • Wnt信号通路(最显著)

  • 细胞衰老、TNF信号通路、p53信号通路

  • 整合5个数据库,预测得到782个TCF7L2靶基因

  • KEGG富集分析显示:

  • 提示TCF7L2激活导致衰老和炎症反应

逻辑解读

→ BML和受损软骨呈现高衰老状态 → 非经典单核细胞和FC-2是最衰老的细胞群 → TCF7L2是单核细胞和软骨细胞共同的衰老调控因子 → TCF7L2激活Wnt、细胞衰老、TNF、p53通路



Figure 5:TCF7L2调控衰老的体外验证

研究目标

验证TCF7L2在单核细胞和软骨细胞衰老中的调控作用,确认其促进SASP的功能。

实验验证方案

实验类型 具体方法 目的
衰老诱导 DOX处理C28/I2(软骨细胞)和THP-1**(单核细胞) 建立体外衰老模型
IHC验证 检测受损和完整软骨中TCF7L2表达 验证临床样本中TCF7L2上调
Transwell共培养 衰老单核细胞与软骨细胞共培养 验证衰老单核细胞诱导软骨细胞衰老
过表达/敲低 TCF7L2过表达和shRNA敲低 验证TCF7L2对衰老和SASP的调控

实验设计与结果

为什么选择DOX诱导衰老? 阿霉素(DOX)是公认的衰老诱导剂,可在单核细胞和软骨细胞中诱导衰老表型,用于模拟体内衰老状态。

关键发现

  1. DOX诱导衰老验证(Fig. 5a-c):
  • DOX处理后,THP-1和C28/I2细胞的TCF7L2、CDKN1A(p21)、SASP基因(HMGB1、TGFB1、CCL4、FGF2、IL7)表达显著上调
  • THP-1中TNF表达上调
  • Western blot证实p21蛋白水平升高
  1. 临床样本验证(Fig. 5d-e):
  • IHC显示:受损软骨的表层区(SZ)和中层区(MZ)TCF7L2+细胞显著多于完整软骨
  • IF显示:TCF7L2在受损软骨中高表达
  1. 衰老单核细胞诱导软骨细胞衰老(Fig. 5f-h):
  • Transwell实验:DOX处理的THP-1与C28/I2共培养
  • 结果:C28/I2中CDKN1A、TCF7L2、SASP基因显著上调
  • 人原代CD14+单核细胞人原代软骨细胞共培养实验得到相同结果
  • 证明:衰老单核细胞通过分泌SASP因子诱导软骨细胞衰老
  1. TCF7L2过表达实验(Fig. 5i, k):
  • CDKN1A、SASP基因(HMGB1、TGFB1、CCL4、FGF2、IL7)上调

  • THP-1中TNF上调

  • p21蛋白水平升高

  • TCF7L2过表达后,THP-1和C28/I2中:

  1. TCF7L2敲低实验(Fig. 5j, l):
  • CDKN1A、SASP基因(HMGB1、TGFB1、IL7)表达下调

  • THP-1中TNF表达下调

  • p21蛋白水平降低

  • shRNA敲低TCF7L2后,在DOX诱导的衰老细胞中:

  • 证明:TCF7L2是衰老和SASP的关键调控因子

逻辑解读

→ TCF7L2在衰老诱导中表达上调 → TCF7L2过表达促进p21表达和SASP因子分泌 → 衰老单核细胞通过SASP诱导软骨细胞衰老 → 敲低TCF7L2可部分逆转衰老表型 → TCF7L2是治疗OA的潜在靶点


研究总结

本研究通过单细胞RNA测序系统解析了骨髓病变(BML)和软骨损伤在骨关节炎中的病理机制,揭示了衰老免疫景观在OA进展中的核心作用。

核心创新点

  1. 首次系统揭示BML的单细胞免疫景观
  • 鉴定出非经典单核细胞作为BML中最关键的促炎和促OA细胞群
  • 发现其具有高炎症、高OA基因特征和高衰老评分
  1. 阐明BML-软骨通讯机制
  • 通过细胞间相互作用CCI)分析,发现*非经典单核细胞通过TNF信号通路诱导软骨细胞(特别是PreFC)损伤
  • PreFC耗竭是受损软骨的重要病理特征
  1. 识别TCF7L2为衰老调控的共同转录因子
  • TCF7L2在单核细胞和软骨细胞中均促进衰老
  • 激活Wnt、细胞衰老、TNF、p53信号通路
  • 促进SASP(衰老相关分泌表型)的发展
  1. 建立"衰老-炎症-软骨损伤"的病理链条
  • BML中衰老的非经典单核细胞 → 分泌TNF等SASP因子 → 诱导PreFC衰老和分化 → PreFC耗竭 → 软骨保护功能丧失 → OA进展

临床意义

  1. 早期诊断标志物 TCF7L2、非经典单核细胞衰老标志物可作为OA早期诊断的生物标志物
  2. 治疗靶点
  • 清除衰老细胞(senolytics)
  • 抑制TCF7L2或其下游Wnt/TNF通路
  • 保护PreFC防止其向病理性软骨细胞分化
  1. 治疗策略 针对BML的关节内或骨内治疗可能阻断BML-软骨通讯,延缓OA进展

研究局限与展望

  1. 样本量较小(n=4),未来需扩大队列验证
  2. 缺乏空间转录组数据,无法精确定位衰老细胞的空间分布和SASP的局部效应
  3. 体内验证有限,需在动物模型中验证靶向TCF7L2的治疗效果

本研究为理解OA发病机制提供了单细胞水平的系统性视角,揭示了衰老、炎症和骨-软骨通讯在OA中的整合作用,为开发精准治疗策略奠定了理论基础。

©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
【社区内容提示】社区部分内容疑似由AI辅助生成,浏览时请结合常识与多方信息审慎甄别。
平台声明:文章内容(如有图片或视频亦包括在内)由作者上传并发布,文章内容仅代表作者本人观点,简书系信息发布平台,仅提供信息存储服务。

相关阅读更多精彩内容

友情链接更多精彩内容